您的账号已在其他设备登录,您当前账号已强迫下线,
如非您本人操作,建议您在会员中心进行密码修改

确定
收藏 | 浏览62 | 下载14

目的 通过对癌症基因组图谱数据库的生物信息学分析,探讨SOX21基因的差异表达在胶质母细胞瘤病人中的预后价值及临床意义.方法 采用Wilcoxon非参数检验比较SOX21基因在胶质母细胞瘤组织和非肿瘤组织中的表达,采用Logistic回归分析SOX21与临床病理特征的关系.进一步采用Kaplan-Meier和Cox回归分析SOX21基因与胶质母细胞瘤病人生存概率的相关性.最后,通过基因集富集分析对SOX21基因的生物学功能进行注释.结果 SOX21基因在胶质母细胞瘤中的表达与亚型显著相关,与经典型相比,间质型、神经元型和前神经元型的差异有统计学意义(P<0.05).Kaplan-Meier生存分析显示,SOX21基因表达下调的胶质母细胞瘤病人预后较SOX21基因表达上调的胶质瘤差(P=0.003).单因素分析表明,SOX21基因表达上调与良好的总生存(OS)相关[HR=0.69,95%CI(0.54,0.88),P=0.003];多因素分析显示,SOX21基因也与胶质母细胞瘤的OS独立相关[HR=0.70,95%CI(0.55,0.90),P=0.005].基因集富集分析显示,丙酸代谢、缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸降解、过氧化物酶体和赖氨酸降解均集中于SOX21高表达表型.结论 SOX21表达上调可能是胶质母细胞瘤病人良好生存的潜在预后生物标志物.此外,丙酸代谢、缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸的降解、过氧化物酶体和赖氨酸的降解可能

作者:卢玲;黄其柳;黄小妹;吕婷婷;何乾超;梁妮;刁丽梅

来源:中西医结合心脑血管病杂志 2022 年 20卷 3期

知识库介绍

临床诊疗知识库该平台旨在解决临床医护人员在学习、工作中对医学信息的需求,方便快速、便捷的获取实用的医学信息,辅助临床决策参考。该库包含疾病、药品、检查、指南规范、病例文献及循证文献等多种丰富权威的临床资源。

详细介绍
热门关注
免责声明:本知识库提供的有关内容等信息仅供学习参考,不代替医生的诊断和医嘱。

收藏
| 浏览:62 | 下载:14
作者:
卢玲;黄其柳;黄小妹;吕婷婷;何乾超;梁妮;刁丽梅
来源:
中西医结合心脑血管病杂志 2022 年 20卷 3期
标签:
胶质母细胞瘤;SOX21基因;癌症基因组图谱;转录组测序;预后
目的 通过对癌症基因组图谱数据库的生物信息学分析,探讨SOX21基因的差异表达在胶质母细胞瘤病人中的预后价值及临床意义.方法 采用Wilcoxon非参数检验比较SOX21基因在胶质母细胞瘤组织和非肿瘤组织中的表达,采用Logistic回归分析SOX21与临床病理特征的关系.进一步采用Kaplan-Meier和Cox回归分析SOX21基因与胶质母细胞瘤病人生存概率的相关性.最后,通过基因集富集分析对SOX21基因的生物学功能进行注释.结果 SOX21基因在胶质母细胞瘤中的表达与亚型显著相关,与经典型相比,间质型、神经元型和前神经元型的差异有统计学意义(P<0.05).Kaplan-Meier生存分析显示,SOX21基因表达下调的胶质母细胞瘤病人预后较SOX21基因表达上调的胶质瘤差(P=0.003).单因素分析表明,SOX21基因表达上调与良好的总生存(OS)相关[HR=0.69,95%CI(0.54,0.88),P=0.003];多因素分析显示,SOX21基因也与胶质母细胞瘤的OS独立相关[HR=0.70,95%CI(0.55,0.90),P=0.005].基因集富集分析显示,丙酸代谢、缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸降解、过氧化物酶体和赖氨酸降解均集中于SOX21高表达表型.结论 SOX21表达上调可能是胶质母细胞瘤病人良好生存的潜在预后生物标志物.此外,丙酸代谢、缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸的降解、过氧化物酶体和赖氨酸的降解可能