基于网络药理学探求当归四逆汤作用于腰椎间盘突出症的作用机理.系统检索中药系统药理学技术平台(TCMSP)、中药潜在靶点数据库(TCM-PTD)获取当归四逆汤药物的有效活性成分45个,作用靶点132个,并将得到的靶点与通用蛋白数据库(Uniprot)中载入的基因名称简称进行匹配.通过检索人类基因数据库(GeneCards)和孟德尔疾病基因数据库(O M I M)来获取腰椎间盘突出症的作用靶点,汇入表格并去除重复靶点之后,共得到有效靶点379个.使用ClusterProfiler R编程软件绘制Venn图,获取药物和疾病共同作用的靶点25个.利用Cytoscape Version 3.6.1软件,构建当归四逆汤活性成分-药物疾病共同作用靶蛋白网络.将药物疾病共同作用靶点导入功能性蛋白关联网络平台(STRING),获取蛋白互作网络,并使用Cytoscape Version 3.6.1软件对蛋白互作网络图进行拓扑分析和注释分析,得到核心靶点AKT1、PTGS2、MAPK1、STAT3、MAPK8、JUN、CASP3、MAPK14等.使用ClusterProfiler R软件对疾病药物公共作用靶点进行基因本体论(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书数据库(KEGG)通路富集分析,并用Cytoscape Version 3.6.1绘制靶点-通路网络图,得到当归四逆汤的有效活性成分paeoniflorin、beta-sitosterol、kaempferol、(+)-catechin、stigmasterol、
作者:张水冰;李颖;赵思怡;黄帆;海那尔·乌拉孜巴依;丘明旺;方婉仪;姚琳;张茂祥
来源:激光生物学报 2021 年 30卷 3期