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结直肠癌是世界范围内最为常见的恶性肿瘤之一,目前,关于结直肠癌的分子机制仍在不断的探索中.本文通过生物信息学方法筛选和鉴定结直肠癌关键的生物标志物.从基因表达数据库(GEO)选择了3个数据集[GSE21510(148个样本)、GSE32323(44个样本)、GSE15781(42个样本)],对差异基因的表达以及功能富集进行分析.通过建立蛋白互作网络,运用STRING和Cytoscape对分子进行分析.筛选出472个差异基因,其中上调基因212个,下调基因260个.差异基因的富集及其通路主要包括调节细胞增殖、识别受体信号通路、过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)信号通路等.其中15个核心基因主要富集在受体蛋白信号通路、细胞表面受体信号和趋化因子信号通路上.生存分析表明,AGT、CXCL2可能参与致癌,促进癌症的转移,影响预后.通过对472个差异基因和15个核心基因的筛选识别,促癌基因AGT和CXCL2可能被视为结直肠癌的生物标志物,为结直肠癌的诊断、治疗和研究提供新的分子靶标.

作者:张永玲;范文涛

来源:激光生物学报 2021 年 30卷 4期

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作者:
张永玲;范文涛
来源:
激光生物学报 2021 年 30卷 4期
标签:
生物信息学 结直肠癌 生物标志物 促癌基因
结直肠癌是世界范围内最为常见的恶性肿瘤之一,目前,关于结直肠癌的分子机制仍在不断的探索中.本文通过生物信息学方法筛选和鉴定结直肠癌关键的生物标志物.从基因表达数据库(GEO)选择了3个数据集[GSE21510(148个样本)、GSE32323(44个样本)、GSE15781(42个样本)],对差异基因的表达以及功能富集进行分析.通过建立蛋白互作网络,运用STRING和Cytoscape对分子进行分析.筛选出472个差异基因,其中上调基因212个,下调基因260个.差异基因的富集及其通路主要包括调节细胞增殖、识别受体信号通路、过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)信号通路等.其中15个核心基因主要富集在受体蛋白信号通路、细胞表面受体信号和趋化因子信号通路上.生存分析表明,AGT、CXCL2可能参与致癌,促进癌症的转移,影响预后.通过对472个差异基因和15个核心基因的筛选识别,促癌基因AGT和CXCL2可能被视为结直肠癌的生物标志物,为结直肠癌的诊断、治疗和研究提供新的分子靶标.