目的:探讨lncRNA44372在卵巢癌中的表达及其在卵巢癌发生发展过程中的作用机制.方法:从NCBI GEO数据库中下载卵巢癌样本及其对照样本的基因芯片数据GSE119054,选用在线工具CRN分析在卵巢癌中差异表达的lncRNA;利用在线工具Annolnc筛选与lncRNA44372有关的共表达基因,然后使用David进行基因本体论(Gene Ontology,GO)分析、信号通路富集分析;通过starbase构建lncRNA44372可能存在的竞争性内源RNA网络;用qRT-PCR检测lncRNA44372在卵巢癌细胞系中的表达.结果:GSE119054数据集中筛选出在卵巢癌中表达上调的lncRNA有6个,表达下调的lncRNA有4个;GO分析显示,与lncRNA44372相关的共表达基因在细胞凋亡、细胞周期调控和蛋白苏氨酸/酪氨酸磷酸酶活性中具有调控作用.信号通路分析显示,与lncRNA44372相关的共表达基因主要参与细胞凋亡、肿瘤形成及发展相关的信号通路.lncRNA44372可与miR-190和miR-193结合并调控Unc-51自噬激活激酶-2(ULK2)和依赖LON的过氧化物酶体-2(LONP2)在卵巢癌中的表达.qRT-PCR结果显示,lncRNA44372在卵巢癌细胞系中表达量较卵巢正常细胞系低(P<0.05).结论:lncRNA44372在卵巢癌中呈低表达,其可能通过影响细胞凋亡、细胞周期等参与卵巢癌的发生发展.
作者:丁璟;杨鑫鑫;邹雪琴;高淑君;刘雪;潘玲丽;张鳅丹;赵杨静;梁秀婷;王荟;朱彦玲;邵启祥
来源:江苏大学学报(医学版) 2021 年 31卷 5期