目的 鉴定健康人与多发性骨髓瘤(multiple myeloma,MM)患者脂肪基质细胞的基因表达差异,为MM研究提供依据.方法 利用基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)下载与多发性骨髓瘤基质细胞和正常脂肪基质细胞相关的GSE133346微阵列数据芯片,通过R语言软件对数据经过标准化、校准、log2转化、转换基因ID和补充缺失值,然后以|log fold change(FC)|>1.5以及差异值P<0.05为标准筛选数据库中经校准的表达基因.差异基因通过注释、可视化和集成在线数据库(DAVID)获得GO富集分析结果 ,包括生物过程(biological processes,BP)、细胞成分(cellular components,CC)、分子功能(molecular functions,MF).蛋白功能关系网络(STRING)在线数据库对筛选出的差异基因进行分析,利用图形化显示、分析和编辑蛋白网络的软件(Cytoscape)进行拓扑学分析筛选出关键差异基因.通过癌症数据在线分析和挖掘的网站(UALCAN)分析评估相关关键差异基因的表达结果.结果24个样本(MM患者和健康者各12例)来源的脂肪基质细胞,筛选出差异基因148个,其中上调47个,下调101个.GO和KEGG富集分析结果中,BP主要富集在白细胞迁移、细胞黏附、细胞对成纤维细胞生长因子刺激的反应、细胞外基质组织.CC主要富集在细胞外外泌体、内质网腔、细胞外区域、细
作者：宋宜来；刘中国
来源：解放军医学院学报 2020 年 41卷 4期
