目的:了解莆田地区人乳头状瘤病毒(HPV)58型 L1基因结构特点和变异规律,为临床治疗和预防提供理论依据。方法采用核酸分子快速导流杂交基因分型芯片(HybriMax)进行 HPV 基因分型,随机选4例HPV 58型阳性标本,进行基因克隆测序;进一步用 DNAstar ,clustalx 2.0和 Mega5.0软件对测序结果与 GenBank中发布的其他国家及国内的32株 HPV 58型病毒株 L1基因核苷酸和氨基酸序列建立同源性矩阵并分析,同时进行进化树构建。结果4株 HPV 58型病毒株之间的核苷酸同源性为96%~98%,氨基酸同源性为92%~98%;1986年法国株之间的核苷酸同源性为83%~86%,氨基酸同源性为84%~89%;1987年英国株之间的核苷酸同源性为53%~54%,氨基酸同源性为39%~42%;国内2010年香港分离株、2004年江苏分离株之间核苷酸的同源性为96%~100%,氨基酸同源性为92%~99%。从构建系统进化树图可以看出,4株本地区 HPV 58型病毒株分别与上海和香港 EV999963、DQ057326、HM639611病毒株基因背景最紧密。结论本地区 HPV 58型 L1基因具有一定的区域性特点。
作者:涂海健;俞柳敏;李励军;陈智伟
来源:检验医学与临床 2013 年 23期