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目的 检测miR-27 a在原发性痛风性关节炎(PGA)患者的表达水平,运用生物信息学方法研究miR-27 a及其靶基因在PGA发生、发展过程中的作用.方法 采用实时荧光定量PCR检测miR-27 a在PGA患者外周血单个核细胞中的表达水平,应用UCSC基因组在线软件分析miR-27 a在不同物种间的保守性,采用TargetScan、miRDB和RNA22数据库进行靶基因预测,并结合GeneCards数据库,对痛风相关的靶基因进行GO富集分析和KEGG信号通路分析.结果 miR-27a在PGA患者中表达明显降低,其核苷酸序列在多物种间呈高度保守性.受miR-27a调控,且与PGA疾病相关的潜在靶基因包括MAPK14、RFX3、ABCA1、HS2ST1、ENPEP和CACNA2D3等.GO富集分析发现,miR-27a的靶基因参与细胞代谢调节及对外界刺激的反应等多种生物学功能.KEGG信号通路分析发现,miR-27 a的靶基因显著富集在MAPK信号通路、细胞因子-细胞因子受体相互作用、糖尿病通路和醛固酮控制的钠盐重吸收通路等.结论 miR-27 a可能通过调控多个与痛风发病相关的靶基因,参与多条信号通路的调节,从而参与痛风炎症免疫反应机制.

作者:苟海梅;陈莹;徐磊;李九龙;郭晓兰;钟晓武

来源:检验医学与临床 2022 年 19卷 10期

知识库介绍

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作者:
苟海梅;陈莹;徐磊;李九龙;郭晓兰;钟晓武
来源:
检验医学与临床 2022 年 19卷 10期
标签:
miR-27a 痛风 靶基因 GO富集 KEGG信号通路
目的 检测miR-27 a在原发性痛风性关节炎(PGA)患者的表达水平,运用生物信息学方法研究miR-27 a及其靶基因在PGA发生、发展过程中的作用.方法 采用实时荧光定量PCR检测miR-27 a在PGA患者外周血单个核细胞中的表达水平,应用UCSC基因组在线软件分析miR-27 a在不同物种间的保守性,采用TargetScan、miRDB和RNA22数据库进行靶基因预测,并结合GeneCards数据库,对痛风相关的靶基因进行GO富集分析和KEGG信号通路分析.结果 miR-27a在PGA患者中表达明显降低,其核苷酸序列在多物种间呈高度保守性.受miR-27a调控,且与PGA疾病相关的潜在靶基因包括MAPK14、RFX3、ABCA1、HS2ST1、ENPEP和CACNA2D3等.GO富集分析发现,miR-27a的靶基因参与细胞代谢调节及对外界刺激的反应等多种生物学功能.KEGG信号通路分析发现,miR-27 a的靶基因显著富集在MAPK信号通路、细胞因子-细胞因子受体相互作用、糖尿病通路和醛固酮控制的钠盐重吸收通路等.结论 miR-27 a可能通过调控多个与痛风发病相关的靶基因,参与多条信号通路的调节,从而参与痛风炎症免疫反应机制.