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目的:检测miR-410在系统性红斑狼疮患者(SLE)中的表达水平,运用生物信息学方法研究miR-410及其靶基因在SLE发生发展过程中的作用.方法:定量检测miR-410在SLE患者外周血单个核细胞中的表达水平,并通过miR-410序列分析,靶基因预测和Genecards数据库分析,进一步对其靶基因进行GO富集和KEGG Pathway分析.结果:miR-410在SLE患者中表达显著降低,其核苷酸序列在多物种间呈高度保守性.受miR-410调控且与SLE疾病相关的潜在靶基因包括FASLG、CSF2、IFNAR2、MAPK1、PLCG2、IIA等.GO分析发现miR-410的靶基因参与细胞生长增殖、程序性死亡、细胞分化、免疫系统发育等多个生物过程.KEGG Pathway分析发现miR-410的靶基因显著富集在肿瘤途径信号通路、细胞因子-细胞因子受体相互作用信号通路、胶质瘤信号通路、黑色素瘤信号通路、TGF-β和JAK-STAT信号通路等.结论:miR-410可能通过直接靶向作用其调控靶分子,影响SLE患者体内多条信号通路的网络调控,从而参与SLE疾病的发生和发展.

作者:张济;欧大明;黄丽芳;欧阳琳;邹礼衡

来源:中国免疫学杂志 2017 年 33卷 6期

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作者:
张济;欧大明;黄丽芳;欧阳琳;邹礼衡
来源:
中国免疫学杂志 2017 年 33卷 6期
标签:
miR-410 SLE 靶基因 GO富集 KEGG信号通路 miR-410 SLE Target gene GO enrichment KEGG pathway
目的:检测miR-410在系统性红斑狼疮患者(SLE)中的表达水平,运用生物信息学方法研究miR-410及其靶基因在SLE发生发展过程中的作用.方法:定量检测miR-410在SLE患者外周血单个核细胞中的表达水平,并通过miR-410序列分析,靶基因预测和Genecards数据库分析,进一步对其靶基因进行GO富集和KEGG Pathway分析.结果:miR-410在SLE患者中表达显著降低,其核苷酸序列在多物种间呈高度保守性.受miR-410调控且与SLE疾病相关的潜在靶基因包括FASLG、CSF2、IFNAR2、MAPK1、PLCG2、IIA等.GO分析发现miR-410的靶基因参与细胞生长增殖、程序性死亡、细胞分化、免疫系统发育等多个生物过程.KEGG Pathway分析发现miR-410的靶基因显著富集在肿瘤途径信号通路、细胞因子-细胞因子受体相互作用信号通路、胶质瘤信号通路、黑色素瘤信号通路、TGF-β和JAK-STAT信号通路等.结论:miR-410可能通过直接靶向作用其调控靶分子,影响SLE患者体内多条信号通路的网络调控,从而参与SLE疾病的发生和发展.