基于高通量测序的凡纳滨对虾的转录组分析-临床诊疗知识库

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作者：

曾地刚；陈秀荔；谢达祥；赵永贞；杨春玲；马宁；李咏梅；陈晓汉

来源：

基因组学与应用生物学 2013 年 3期

标签：

高通量测序凡纳滨对虾转录组 High-throughput sequencing Litopenaeus vannamei Transcriptome

凡纳滨对虾是世界养殖最广泛的甲壳动物，但是目前凡纳滨对虾的基因组及转录组数据还比较缺乏。为了获得凡纳滨对虾的转录组信息，本研究应用454高通量测序技术对凡纳滨对虾肝胰腺的转录组进行测序。获得了500177条凡纳滨对虾EST，平均长度363 bp。拼接获得了20225条unigene，长度范围50~8980 bp，平均长度507 bp。所有unigene与NCBI的非冗余蛋白质数据库(Nr)进行相似搜索(E值<10-5)，结果一共有13676条unigene (68

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