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目的 探讨血清HCV RNA阳性,但PCR-荧光探针法病毒亚型检测未检出的原因.方法 收集2015年7月至2016年3月北京佑安医院临检中心分子室病毒载量>1 000 IU/mL但未测出病毒亚型的标本55例,采用基因测序方法对病毒扩增产物进行分型分析.结果 55例HCV病毒载量>1 000 IU/mL,但HCV病毒亚型未检出的标本中,其中3例为病毒载量接近病毒亚型检测下限,经测序分析为1b型2例,2a型1例;5例为检测试剂盒未覆盖亚型并且其探针位置无突变,HCV 1a型4例,6n型1例,占9.1% (5/55);47例因探针序列位置基因突变导致病毒亚型未检出,占85.5% (47/55),经测序发现其中1a型6例(6/47,12.8%),1b型32例(32/47,68.1%),2a型3例(3/47,6.4%),2b型1例(1/47,2.1%),3b型1例(1/47,2.1%),6a型2例(2/47,4.3%),1b、6q、6c混合型1例(1/47,2.1%),6n型1例(1/47,2.1%).探针序列位置基因突变组中以HCV病毒5'非翻译区(5'UTR) 204 C/T突变为主(31/47,66.0%),其次为5'UTR 168 C/A突变(5/47,10.6%).结论 病毒载量低、试剂盒覆盖的病毒亚型有限、探针对应的序列存在变异均会影响PCR-荧光探针法检测HCV基因型,其中探针序列变异是病毒亚型未测出的主要原因.

作者:张立丽;侯玉丽;赵艳明;黄雁翔;于艳华;娄金丽;赵艳

来源:临床检验杂志 2017 年 35卷 4期

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作者:
张立丽;侯玉丽;赵艳明;黄雁翔;于艳华;娄金丽;赵艳
来源:
临床检验杂志 2017 年 35卷 4期
标签:
丙型肝炎病毒 病毒基因型 病毒变异 病毒载量
目的 探讨血清HCV RNA阳性,但PCR-荧光探针法病毒亚型检测未检出的原因.方法 收集2015年7月至2016年3月北京佑安医院临检中心分子室病毒载量>1 000 IU/mL但未测出病毒亚型的标本55例,采用基因测序方法对病毒扩增产物进行分型分析.结果 55例HCV病毒载量>1 000 IU/mL,但HCV病毒亚型未检出的标本中,其中3例为病毒载量接近病毒亚型检测下限,经测序分析为1b型2例,2a型1例;5例为检测试剂盒未覆盖亚型并且其探针位置无突变,HCV 1a型4例,6n型1例,占9.1% (5/55);47例因探针序列位置基因突变导致病毒亚型未检出,占85.5% (47/55),经测序发现其中1a型6例(6/47,12.8%),1b型32例(32/47,68.1%),2a型3例(3/47,6.4%),2b型1例(1/47,2.1%),3b型1例(1/47,2.1%),6a型2例(2/47,4.3%),1b、6q、6c混合型1例(1/47,2.1%),6n型1例(1/47,2.1%).探针序列位置基因突变组中以HCV病毒5'非翻译区(5'UTR) 204 C/T突变为主(31/47,66.0%),其次为5'UTR 168 C/A突变(5/47,10.6%).结论 病毒载量低、试剂盒覆盖的病毒亚型有限、探针对应的序列存在变异均会影响PCR-荧光探针法检测HCV基因型,其中探针序列变异是病毒亚型未测出的主要原因.