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目的 了解中国目前传播的麻风分枝杆菌(M.leprae)菌种及单核苷酸多态性(SNPs)型分布与特征.方法 对来自中国22个省市171例麻风患者皮损组织样本,采用巢式PCR扩增麻风分枝杆菌特异16S rRNA保守片段,并对PCR阳性产物直接测序,经BLAST进行序列比对;采用PCR产物限制性酶切基因多态性方法对麻风分枝杆菌进行SNP分型.结果 171例标本扩增片段与来自巴西的麻风分枝杆菌Br4923相似性达99%,均为M.leprae,未检出M.lepromatosis.在85例SNP分型标本中,SNP3型、SNP1型和SNP2型分别占78.8%(67/85)、20% (17/85)和1.2%(1/85),未检出SNP4型.130例16S rRNA序列存在C251T位碱基变异,不同临床型别标本中16S rRNA序列突变及SNP型别分布差异无统计学意义;16S rRNA基因C251T突变与麻风分枝杆菌菌株的SNP分型有一定的关联,存在突变的菌株多为SNP3型,少见SNP1型,未见SNP2型;不同地区的SNP型别分布之间差异有统计学意义,内陆地区的SNP3型菌株分布率97.1%(34/35)显著高于沿海66% (33/50)(x2=11.96,P<0.01).不同地区的16S rRNA序列突变率差异也有统计学意义,内陆地区的16S rRNA突变率94.8% (92/97)显著高于沿海51.4%(38/74)(x2 =43.56,P<0.01).结论 麻风分枝杆菌16S rRNA基因序列突变C251T与SNP分型有关,可提示不同基因型麻

作者:奚琳琳;李威;温艳;尤元岗;蔡庆春;丁瑞敏;袁有华

来源:临床检验杂志 2018 年 36卷 1期

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作者:
奚琳琳;李威;温艳;尤元岗;蔡庆春;丁瑞敏;袁有华
来源:
临床检验杂志 2018 年 36卷 1期
标签:
麻风分枝杆菌 巢式PCR 16S rRNA Mycobacterium leprae nest PCR 16S rRNA
目的 了解中国目前传播的麻风分枝杆菌(M.leprae)菌种及单核苷酸多态性(SNPs)型分布与特征.方法 对来自中国22个省市171例麻风患者皮损组织样本,采用巢式PCR扩增麻风分枝杆菌特异16S rRNA保守片段,并对PCR阳性产物直接测序,经BLAST进行序列比对;采用PCR产物限制性酶切基因多态性方法对麻风分枝杆菌进行SNP分型.结果 171例标本扩增片段与来自巴西的麻风分枝杆菌Br4923相似性达99%,均为M.leprae,未检出M.lepromatosis.在85例SNP分型标本中,SNP3型、SNP1型和SNP2型分别占78.8%(67/85)、20% (17/85)和1.2%(1/85),未检出SNP4型.130例16S rRNA序列存在C251T位碱基变异,不同临床型别标本中16S rRNA序列突变及SNP型别分布差异无统计学意义;16S rRNA基因C251T突变与麻风分枝杆菌菌株的SNP分型有一定的关联,存在突变的菌株多为SNP3型,少见SNP1型,未见SNP2型;不同地区的SNP型别分布之间差异有统计学意义,内陆地区的SNP3型菌株分布率97.1%(34/35)显著高于沿海66% (33/50)(x2=11.96,P<0.01).不同地区的16S rRNA序列突变率差异也有统计学意义,内陆地区的16S rRNA突变率94.8% (92/97)显著高于沿海51.4%(38/74)(x2 =43.56,P<0.01).结论 麻风分枝杆菌16S rRNA基因序列突变C251T与SNP分型有关,可提示不同基因型麻