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目的:基于TCGA数据库分析分化型甲状腺癌(differentiated thyroid carcinoma,DTC)铁死亡标志物及其预后意义。方法:本研究从TCGA数据库中下载甲状腺癌患者及甲状腺正常样本的RNA表达数据及生存信息。基因差异分析中增加653例来自GETx数据库的正常甲状腺样本。选择22个铁死亡相关基因进行单因素COX分析。使用LASSO回归进一步在TCGA队列中筛选与预后相关基因并构建预后模型。Adjusted P<0.05且|log2FC>1"为阈值筛选出22个差异表达基因。将筛选出的基因进行多因素COX分析,筛选预后相关基因,并构建列线图。 结果:纳入的24个铁死亡相关基因中22个在肿瘤和正常组织中差异表达,其中高表达13个,低表达9个,1个基因表达差异无统计学意义,1个基因在半数样本中无表达。单因素COX分析发现DPP4和TFRC与疾病风险程度相关(HR分别为<1和>1)。将GPX4、TFRC和DPP4纳入LASSO模型筛选后,以公式lambda.min=0.002 7,Riskscore=(0.731 6)×TFRC+(-0.253 9)×DPP4,将患者进行危险程度分组后发现与预后相关(Log rank P=0.006 35)。多因素COX分析发现DPP4和TFRC与疾病风险程度相关(HR分别为<1和>1)。 结论:铁死亡相关差异表达基因TFRC和DPP4构建的模型可能是DTC患者潜在的预后标志物,

作者:韩悦;陈作宇;贾兰宁;何向辉

来源:中华内分泌外科杂志 2022 年 16卷 4期

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作者:
韩悦;陈作宇;贾兰宁;何向辉
来源:
中华内分泌外科杂志 2022 年 16卷 4期
标签:
分化型甲状腺癌 甲状腺乳头状癌 铁死亡相关基因 甲状腺癌 Differentiated thyroid carcinoma Papillary thyroid carcinoma Ferroptosis-related gene Thyroid carcinoma
目的:基于TCGA数据库分析分化型甲状腺癌(differentiated thyroid carcinoma,DTC)铁死亡标志物及其预后意义。方法:本研究从TCGA数据库中下载甲状腺癌患者及甲状腺正常样本的RNA表达数据及生存信息。基因差异分析中增加653例来自GETx数据库的正常甲状腺样本。选择22个铁死亡相关基因进行单因素COX分析。使用LASSO回归进一步在TCGA队列中筛选与预后相关基因并构建预后模型。Adjusted P<0.05且|log2FC>1"为阈值筛选出22个差异表达基因。将筛选出的基因进行多因素COX分析,筛选预后相关基因,并构建列线图。 结果:纳入的24个铁死亡相关基因中22个在肿瘤和正常组织中差异表达,其中高表达13个,低表达9个,1个基因表达差异无统计学意义,1个基因在半数样本中无表达。单因素COX分析发现DPP4和TFRC与疾病风险程度相关(HR分别为<1和>1)。将GPX4、TFRC和DPP4纳入LASSO模型筛选后,以公式lambda.min=0.002 7,Riskscore=(0.731 6)×TFRC+(-0.253 9)×DPP4,将患者进行危险程度分组后发现与预后相关(Log rank P=0.006 35)。多因素COX分析发现DPP4和TFRC与疾病风险程度相关(HR分别为<1和>1)。 结论:铁死亡相关差异表达基因TFRC和DPP4构建的模型可能是DTC患者潜在的预后标志物,