目的 肺癌发生和发展是一个多基因参与、长时间演变的复杂过程.因此有必要对肺癌分子机制进行系统研究.本研究采用癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库分析肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)中差异表达的长链非编码RNA (long non-coding RNA,LncRNA)、信使RNA (messenger RNA,mRNA)和微小RNA (microRNA,miRNA),构建基因间调控网络,并进一步筛选和分析与患者生存预后相关的RNA分子,为肺腺癌分子标志物及治疗靶点的发掘提供依据.方法 TCGA数据库获得535例肺腺癌样本和59例正常肺组织样本的RNA测序(RNAsequencing,RNA-Seq)数据,521例肺腺癌样本和46例正常肺组织样本的miRNA-seq数据以及522例肺腺癌患者临床信息进行分析.使用R语言中的“DESeq”鉴定差异表达RNA.通过miRcode数据库预测差异表达的lncRNA和miR-NA之间的相互作用,并根据TargetScan、miRTarBase和miRDB数据库进一步检索miRNA靶向的mRNA.基于RNA间的相互作用构建lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA网络.使用DAVID 6.8和R语言中的“clusterprofiler”对网络中mRNA基因功能和信号通路进行富集分析.采用Kaplan-Meier生存分析差异表达的RNA与肺腺癌患者生存预后的关联性.采用多因素Cox风险回归筛选出影响肺腺癌患者总体生存率的独立RNA分子.结果

作者：史杨；李爱芳；黄建胜；丁卉；赵志钢

来源：中华肿瘤防治杂志 2020 年 27卷 16期