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目的 研究广州地区丙型肝炎患者HCV基因型分布的变化情况.方法 收集207例HCV RAN阳性丙型肝炎患者血清,对其HCV Core区(C区)和NS5B区基因序列进行RT-nPCR扩增,两区扩增成功的PCR产物进行基因测序,测序结果分别与相应的参照株序列比对,构建系统进化树,两区基因分型结果一致者确定HCV基因亚型.结果 185例HCVC区和NS5B区都扩增成功,其中179例两区基因分型结果一致.共检出1、2、3、6型4种基因型和8种基因亚型,其中1b型占40.78% (73/179),6a型占27.37% (49/179),3b型占11.73%(21/179),3a型占8.94% (16/179),2a型占6.15%(11/179),1a型占3.91%(7/179),2b型占0.56%(1/179),6n型占0.56%(1/179).1b株可分为A、B、C三大簇,A簇与中国广泛流行1b株接近、B簇与中国中部及南部地区流行1b株接近,6a株分为Ⅰ、Ⅱ两大簇,与献血人群及静脉吸毒人群中6a型株接近.结论 广州地区丙型肝炎患者HCV基因型以1b、6a、3型为主,存在多种亚型;1b型株包含中国大部分地区的1b型株,6a、3型已取代2a型分别成为第二、三主要流行基因型;未发现6型变异株.

作者:肖桂娥;魏绍静;张复春;陈伟烈;兰芸;饶嫚;钟剑波

来源:热带医学杂志 2014 年 14卷 5期

知识库介绍

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作者:
肖桂娥;魏绍静;张复春;陈伟烈;兰芸;饶嫚;钟剑波
来源:
热带医学杂志 2014 年 14卷 5期
标签:
丙型肝炎病毒 基因型 C区 NS5B区 进化树 hepatitis C virus genotype C region NS5B region phylogeny
目的 研究广州地区丙型肝炎患者HCV基因型分布的变化情况.方法 收集207例HCV RAN阳性丙型肝炎患者血清,对其HCV Core区(C区)和NS5B区基因序列进行RT-nPCR扩增,两区扩增成功的PCR产物进行基因测序,测序结果分别与相应的参照株序列比对,构建系统进化树,两区基因分型结果一致者确定HCV基因亚型.结果 185例HCVC区和NS5B区都扩增成功,其中179例两区基因分型结果一致.共检出1、2、3、6型4种基因型和8种基因亚型,其中1b型占40.78% (73/179),6a型占27.37% (49/179),3b型占11.73%(21/179),3a型占8.94% (16/179),2a型占6.15%(11/179),1a型占3.91%(7/179),2b型占0.56%(1/179),6n型占0.56%(1/179).1b株可分为A、B、C三大簇,A簇与中国广泛流行1b株接近、B簇与中国中部及南部地区流行1b株接近,6a株分为Ⅰ、Ⅱ两大簇,与献血人群及静脉吸毒人群中6a型株接近.结论 广州地区丙型肝炎患者HCV基因型以1b、6a、3型为主,存在多种亚型;1b型株包含中国大部分地区的1b型株,6a、3型已取代2a型分别成为第二、三主要流行基因型;未发现6型变异株.