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目的 研究深圳市第二人民医院血液透析中心维持性血液透析(maintenance hemodialysis,MHD)患者丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)感染的基因型及同源性,结合临床流行病学资料,为血液透析中心HCV感染的防治提供依据.方法 荧光定量聚合酶链反应(PCR)法测定抗-HCV阳性的MHD患者的HCV-RNA定量,对HCV-RNA定量≥1×103 IU/ml的MHD患者,通过巢氏反转录(RT)-PCR对5'UTR及NS5B区进行扩增,扩增产物通过Sequence Scanner vl.0导出峰图,Muscle进行序列比对,MEGA5.1构建进化树以确定基因分型,bootstrap 1000检验进化树可靠性,Blat进行序列同源性分析. 结果 183例MHD患者中,抗-HCV阳性13例,抗-HCV阳性率为7.1%.HCV-RNA定量≥l×103 IU/ml者9例中,lb型7例,6a型2例.lb型中,PC1与PC2间的遗传距离为0.000,PBC17与PC2间的遗传距离为0.008,PC29与PBC31间的遗传距离为0.035,PC32与PBC34间的遗传距离为0.102;6a型中,PCll与PC20间的遗传距离为0.068.PC1与PC2的同源性为100%,PC2与PBC17的同源性为99.23%,PC29与PBC31同源性为96.63%,PC32与PBC34的同源性为90.64%,PCll与PC20同源性为93.63%.9例患者的平均感染时间为(67.4±26.3)月,平均透析时间为(81.5±38.1)月,4例(PC2、PCll、PC29和PBC31)为输入性HCV感染者,另5例(PC1

作者:陈嘉;何永成;栾韶东

来源:中国血液净化 2013 年 12卷 8期

知识库介绍

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作者:
陈嘉;何永成;栾韶东
来源:
中国血液净化 2013 年 12卷 8期
标签:
丙型肝炎病毒 基因型 血液透析 系统进化树 Hepatitis C virus Genotype Hemodialysis Polygenetic tree
目的 研究深圳市第二人民医院血液透析中心维持性血液透析(maintenance hemodialysis,MHD)患者丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)感染的基因型及同源性,结合临床流行病学资料,为血液透析中心HCV感染的防治提供依据.方法 荧光定量聚合酶链反应(PCR)法测定抗-HCV阳性的MHD患者的HCV-RNA定量,对HCV-RNA定量≥1×103 IU/ml的MHD患者,通过巢氏反转录(RT)-PCR对5'UTR及NS5B区进行扩增,扩增产物通过Sequence Scanner vl.0导出峰图,Muscle进行序列比对,MEGA5.1构建进化树以确定基因分型,bootstrap 1000检验进化树可靠性,Blat进行序列同源性分析. 结果 183例MHD患者中,抗-HCV阳性13例,抗-HCV阳性率为7.1%.HCV-RNA定量≥l×103 IU/ml者9例中,lb型7例,6a型2例.lb型中,PC1与PC2间的遗传距离为0.000,PBC17与PC2间的遗传距离为0.008,PC29与PBC31间的遗传距离为0.035,PC32与PBC34间的遗传距离为0.102;6a型中,PCll与PC20间的遗传距离为0.068.PC1与PC2的同源性为100%,PC2与PBC17的同源性为99.23%,PC29与PBC31同源性为96.63%,PC32与PBC34的同源性为90.64%,PCll与PC20同源性为93.63%.9例患者的平均感染时间为(67.4±26.3)月,平均透析时间为(81.5±38.1)月,4例(PC2、PCll、PC29和PBC31)为输入性HCV感染者,另5例(PC1