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目的:通过网络药理学方法系统化探究黄芪桂枝五物汤治疗胃溃疡的功效网络,并用分子对接技术进行验证.方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取黄芪桂枝五物汤的有效化合物及作用靶点,利用在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、基因疾病关联数据库(DisGeNET)、人类基因数据库(GeneCards)、毒性与基因比较数据库(CTD)获取胃溃疡的疾病靶点,经靶点映射获取黄芪桂枝五物汤与胃溃疡的共同作用靶点,通过STRING数据库获取靶点之间的关系信息,应用Cytoscape 3.6.2可视化处理,并通过生物学信息注释数据库(DAVID)进行基因本体论(G0)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.运用Schrodinger软件包完成分子对接.结果:共获得槲皮素、β-谷甾醇、蛇床子素、ent-表儿茶素等58个有效化学成分和抑癌基因p53 (TP53)、前列腺素内过氧化物合酶(PTGS2)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、肿瘤坏死因子(TNF)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、白细胞介素-6(IL-6)等35个作用靶点,经GO富集分析得到生物学过程261个,细胞组分29个,分子功能37个,经KEGG富集分析得到79条相关通路,其中与PI3K/Akt信号通路、TNF信号通路、缺氧诱导因子-1(HIF-1)信号通路密切相关.分子对接示靶蛋白与主要化学成分结合能较强,结合力好.结论:黄

作者:陈婷;王伟;刘维菊;曹志群;王云鹏;姜璐;薛晔;胡冬青;李玲玲

来源:山东中医药大学学报 2021 年 45卷 2期

知识库介绍

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作者:
陈婷;王伟;刘维菊;曹志群;王云鹏;姜璐;薛晔;胡冬青;李玲玲
来源:
山东中医药大学学报 2021 年 45卷 2期
标签:
黄芪桂枝五物汤 胃溃疡 有效成分 靶点 分子对接技术 网络药理学
目的:通过网络药理学方法系统化探究黄芪桂枝五物汤治疗胃溃疡的功效网络,并用分子对接技术进行验证.方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取黄芪桂枝五物汤的有效化合物及作用靶点,利用在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、基因疾病关联数据库(DisGeNET)、人类基因数据库(GeneCards)、毒性与基因比较数据库(CTD)获取胃溃疡的疾病靶点,经靶点映射获取黄芪桂枝五物汤与胃溃疡的共同作用靶点,通过STRING数据库获取靶点之间的关系信息,应用Cytoscape 3.6.2可视化处理,并通过生物学信息注释数据库(DAVID)进行基因本体论(G0)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.运用Schrodinger软件包完成分子对接.结果:共获得槲皮素、β-谷甾醇、蛇床子素、ent-表儿茶素等58个有效化学成分和抑癌基因p53 (TP53)、前列腺素内过氧化物合酶(PTGS2)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、肿瘤坏死因子(TNF)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、白细胞介素-6(IL-6)等35个作用靶点,经GO富集分析得到生物学过程261个,细胞组分29个,分子功能37个,经KEGG富集分析得到79条相关通路,其中与PI3K/Akt信号通路、TNF信号通路、缺氧诱导因子-1(HIF-1)信号通路密切相关.分子对接示靶蛋白与主要化学成分结合能较强,结合力好.结论:黄