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目的设计用于人巨细胞病毒(HCMV)诊断的60-mer长链寡核苷酸探针及微阵列.方法利用生物学软件Array Designer2.0,针对HCMV特异且保守的序列设计60-mer探针,利用BLAST功能将设计探针在GenBank数据库进行序列比对分析,筛选得到HCMV特异性Oligo探针,根据各探针的属性特点设计芯片阵列.结果设计得到24条解链温度(Tm值)相近、长度均一的60-mer Oligo探针及其芯片阵列,拟打印成DNA芯片用于HCMV检测.结论利用病原体的生物信息学资料及Array Designer2.0生物软件,能有效的进行病毒检测芯片的设计.

作者:张亚莉;马文丽;赵海全;莫小阳;郑文岭

来源:山东医药 2006 年 46卷 8期

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作者:
张亚莉;马文丽;赵海全;莫小阳;郑文岭
来源:
山东医药 2006 年 46卷 8期
标签:
人巨细胞病毒 寡核苷酸序列分析 基因芯片 Oligo探针
目的设计用于人巨细胞病毒(HCMV)诊断的60-mer长链寡核苷酸探针及微阵列.方法利用生物学软件Array Designer2.0,针对HCMV特异且保守的序列设计60-mer探针,利用BLAST功能将设计探针在GenBank数据库进行序列比对分析,筛选得到HCMV特异性Oligo探针,根据各探针的属性特点设计芯片阵列.结果设计得到24条解链温度(Tm值)相近、长度均一的60-mer Oligo探针及其芯片阵列,拟打印成DNA芯片用于HCMV检测.结论利用病原体的生物信息学资料及Array Designer2.0生物软件,能有效的进行病毒检测芯片的设计.