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目的 利用网络药理学和分子对接技术分析方法,建立苜蓿素抗结肠癌的“化合物-靶标-疾病-通路”作用网络,来探索苜蓿素抗结肠癌作用机制.方法 通过PubChem和swisstarget数据库来寻找苜蓿素的作用靶标,用Therapeutic target数据库寻找结肠癌疾病的可能相关靶标.采用bioinformatics数据库将两者交叉的靶点进行合并.接着运用String数据库结合Cytoscape软件绘制结肠癌靶点的蛋白相互作用网络,通过david数据库对通路进行富集与分析,采用DISCOVERY STUDIO软件对苜蓿素与作用靶点进行分子对接验证.结果 苜蓿素与结肠癌交叉共有靶点有69个,经通路分析发现共涉及通路共有55条,有21条通路与癌症相关.分子对接显示苜蓿素分别能与AKT1、EGFR和ESR1蛋白稳定结合.并分别通过氨基酸残基LYS A276、THR A160、THR A195氢键连接、GLY A159、GLY A294、GLU A198碳氢键等连接与AKT1稳定结合;通过THR A570、METB576碳氢键、ALA A573 PI氢键、VAL A575、PRO A572PI烷基、GLY A574 PI酰基与EGFR能稳定对接;通过GLY B457、ARG A434氢键连接、TYR B459、ALA A430、SER A433、ASN B455碳氢键连接等与ESR1稳定结合.结论 本研究揭示了苜蓿素治疗结肠癌具有多靶点、多通路的潜在机制,为后续的研究提供方向与思路.

作者:刘利艳;温世伟;刘卫云;周艳;徐彭

来源:世界科学技术-中医药现代化 2020 年 22卷 4期

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作者:
刘利艳;温世伟;刘卫云;周艳;徐彭
来源:
世界科学技术-中医药现代化 2020 年 22卷 4期
标签:
网络药理学 分子对接 苜蓿素 结肠癌
目的 利用网络药理学和分子对接技术分析方法,建立苜蓿素抗结肠癌的“化合物-靶标-疾病-通路”作用网络,来探索苜蓿素抗结肠癌作用机制.方法 通过PubChem和swisstarget数据库来寻找苜蓿素的作用靶标,用Therapeutic target数据库寻找结肠癌疾病的可能相关靶标.采用bioinformatics数据库将两者交叉的靶点进行合并.接着运用String数据库结合Cytoscape软件绘制结肠癌靶点的蛋白相互作用网络,通过david数据库对通路进行富集与分析,采用DISCOVERY STUDIO软件对苜蓿素与作用靶点进行分子对接验证.结果 苜蓿素与结肠癌交叉共有靶点有69个,经通路分析发现共涉及通路共有55条,有21条通路与癌症相关.分子对接显示苜蓿素分别能与AKT1、EGFR和ESR1蛋白稳定结合.并分别通过氨基酸残基LYS A276、THR A160、THR A195氢键连接、GLY A159、GLY A294、GLU A198碳氢键等连接与AKT1稳定结合;通过THR A570、METB576碳氢键、ALA A573 PI氢键、VAL A575、PRO A572PI烷基、GLY A574 PI酰基与EGFR能稳定对接;通过GLY B457、ARG A434氢键连接、TYR B459、ALA A430、SER A433、ASN B455碳氢键连接等与ESR1稳定结合.结论 本研究揭示了苜蓿素治疗结肠癌具有多靶点、多通路的潜在机制,为后续的研究提供方向与思路.