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目的 开展乳粉原料中分离的阪崎克罗诺杆菌(Cronobacter sakazakii,C.sakazakii)鉴定分型比较研究及抗生素耐药基因特征分析.方法 采用形态学观察、生理生化特征分析、基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱法、16SrDNA测序分析,和基于全基因组测序技术的平均核苷酸一致性分析、多位点序列分型和基于全基因组的多位点序列分型技术,建立了对分离的2株C.sakazakii的鉴定分型方法,并对不同的方法进行比较,同时预测O-血清型和抗生素抗性基因.结果 本研究中分离菌株16-26、31-3经形态学、生理生化反应、16S rDNA、质谱和平均核苷酸一致性分析,均鉴定为C.sakazakii,可信度均在95%以上;MLST预测16-26为ST新型、31-3为ST4型,O血清型均为gnd3型、galF 2型,均含有9种抗性基因,2株C.sakazakii分离株的抗性基因呈现出多样性.结论 通过对分离的C.sakazakii进行鉴定分型比较研究,建立了一种基于表型和分子分型的食源性致病菌鉴定分型方法,为食源性致病菌的有效防控提供了有力的技术支撑和监管依据.

作者:伊廷存;程祥龙;郑世超;孟静;胡梅;霍胜楠

来源:食品安全质量检测学报 2023 年 14卷 9期

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作者:
伊廷存;程祥龙;郑世超;孟静;胡梅;霍胜楠
来源:
食品安全质量检测学报 2023 年 14卷 9期
标签:
阪崎克罗诺杆菌 鉴定分型 全基因组测序 多位点序列分型
目的 开展乳粉原料中分离的阪崎克罗诺杆菌(Cronobacter sakazakii,C.sakazakii)鉴定分型比较研究及抗生素耐药基因特征分析.方法 采用形态学观察、生理生化特征分析、基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱法、16SrDNA测序分析,和基于全基因组测序技术的平均核苷酸一致性分析、多位点序列分型和基于全基因组的多位点序列分型技术,建立了对分离的2株C.sakazakii的鉴定分型方法,并对不同的方法进行比较,同时预测O-血清型和抗生素抗性基因.结果 本研究中分离菌株16-26、31-3经形态学、生理生化反应、16S rDNA、质谱和平均核苷酸一致性分析,均鉴定为C.sakazakii,可信度均在95%以上;MLST预测16-26为ST新型、31-3为ST4型,O血清型均为gnd3型、galF 2型,均含有9种抗性基因,2株C.sakazakii分离株的抗性基因呈现出多样性.结论 通过对分离的C.sakazakii进行鉴定分型比较研究,建立了一种基于表型和分子分型的食源性致病菌鉴定分型方法,为食源性致病菌的有效防控提供了有力的技术支撑和监管依据.