跨膜蛋白18基因(TMEM-18)是一个末端为低聚嘧啶的基因,与动物生长发育密切相关.为了研究牦牛TMEM-18基因多态性与生产性能的关系.以192头天祝雌性牦牛血样NDA构建混合池,扩增TMEM-18基因内含子1和外显子5的序列.运用BLAST和Chromas软件分析突变位点,运用高分辨率熔解曲线分析技术(HRM)统计基因型分型,采用SHEsis软件进行基因型频率和等位基因频率计算,同时对多态位点进行配对连锁不平衡和单倍型分析,运用SPSS21.0分析基因多态位点与生产性能关联.结果表明,牦牛TMEM-18基因内含子1处存在2个多态位点,分别是861(A/G)和1267 (C/T),外显子5处存在1个多态位点为4 447(C/T).关联分析表明,牦牛TMEM-18基因861 (A/G)位点的不同基因型与牦牛的体高、体重、胴体重和屠宰率差异性显著(P<0.05);1267(C/T)位点的不同基因型与牦牛的体高、体重和屠宰率差异性显著(P<0.05),而牦牛TME M-18基因4447(C/T)位点的不同基因型与牦牛的体斜长、管围、胸围、体重、胴体重、净肉重、净肉率和屠宰率均存在显著性差异(P<0.05).通过单倍型分析发现群体中存在3种单倍型组合,即ACC单倍型、GTC单倍型和GTr单倍型,其中ACC单倍型组合个体数目明显多于其他单倍型组合,为优势单倍型.本实验揭示TMEM-18基因可作为牦牛生产性能开发的候选分
作者:张欢;张全伟;王琪;马友记;张勇;赵兴绪
来源:生物技术通报 2017 年 33卷 2期