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通过不同的聚类方式,对公共数据库中生物序列数据进行生物信息的挖掘,以达到在更广泛和更深入的框架中了解它们之间的相互关系的目的.以帕金森病相关基因所对应的mRNA序列为例,使用双序列比对的得分值作为序列之间的距离定义.同时为解决不同聚类分析之间的差异,分别采用模糊聚类和层次聚类两种不同的方法进行聚类分析.并由不同聚类方法得到的一致分类聚类的结果为基因功能分类提供支持,为进一步揭示生物序列所蕴涵的生物学知识和生物学规律提供可参考的依据.

作者:杨晶;高韡;谷小萱;张向宇;魏雪丽;田心

来源:生物信息学 2009 年 7卷 1期

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作者:
杨晶;高韡;谷小萱;张向宇;魏雪丽;田心
来源:
生物信息学 2009 年 7卷 1期
标签:
生物序列 序列的比对 基因 模糊聚类 层次聚类
通过不同的聚类方式,对公共数据库中生物序列数据进行生物信息的挖掘,以达到在更广泛和更深入的框架中了解它们之间的相互关系的目的.以帕金森病相关基因所对应的mRNA序列为例,使用双序列比对的得分值作为序列之间的距离定义.同时为解决不同聚类分析之间的差异,分别采用模糊聚类和层次聚类两种不同的方法进行聚类分析.并由不同聚类方法得到的一致分类聚类的结果为基因功能分类提供支持,为进一步揭示生物序列所蕴涵的生物学知识和生物学规律提供可参考的依据.