目的 利用生物信息学分析筛选IgA肾病相关差异表达基因,旨在深入了解IgA肾病发生机制. 方法 对基因表达综合数据库(GEO数据库)中的IgA肾病患者和正常对照者的血液(数据编号:GSE73953)和肾脏组织(数据编号:GSE93798)芯片结果进行重新注释和分析,应用Morpheus分别对两个芯片结果进行分析筛选差异表达基因,然后取交集得到共有的差异表达基因.应用DAVID数据库对共有的差异表达基因进行GO和KEGG分析,应用STRING对差异表达基因结果进行蛋白互作分析,应用Cytoscape软件筛选关键基因. 结果 应用Morpheus分析芯片结果得到184个共有的差异表达基因,GO分析结果提示差异表达基因多在细胞外基质形成、细胞外结构形成、细胞凋亡、细胞程序性死亡等生物过程富集,在细胞外成分、细胞外基质蛋白、细胞外空间等细胞组成富集,在细胞功能调节、酶调节活性、大分子复杂结果等分子功能富集.KEGG分析提示差异表达基因在局部粘连、MAPK等通路富集.蛋白互作分析结果提示前10个关键基因,即PTPRC、FN1、PE-CAM1、AGTR1、POSTN、AGT、COL4AI、TP53、CYR61、MGAM.Cytoscape的MCODE分析结果提示最显著的差异表达基因主要富集于肾素-血管紧张素系统等通路. 结论 细胞外基质形成、局部粘连、MAPK等通路可能参与IgA肾病发生发展过程,PTPRC
作者：金美玲；邱强；徐晨；李新；张敏；张伟光；李典耕；赵素梅
来源：山西医科大学学报 2019 年 50卷 6期
