目的:探索胃癌细胞中高表达hnRNP K蛋白直接调控的miRNA.方法:通过制备正常胃黏膜细胞GES-1和胃癌细胞SGC-7901的细胞芯片初筛高表达hnRNP K胃癌细胞miRNA表达谱;查询TCGA数据库得到胃癌大样本mRNA转录组和miRNA数据,分析处理得到hnRNP K以2倍差异高表达对应的miRNA差异表达谱;对芯片和TCGA数据库结果交互分析得到上调共表达的miRNA;过表达和敲除hnRNP K,通过Western Blot和Real Time q-PCR验证筛查的结果;利用TCGA大数据对hnRNP K和miRNA进行归一化处理,验证筛选的miRNA与hnRNP K和胃癌的相关性.结果:通过芯片初筛miRNA表达谱与TCGA查询结果交互分析得到胃癌上调miRNA共表达谱(miR-17/20a/24/182);Western Blot和Real Time q-PCR验证结果显示hnRNP K可直接调控miR-20a的表达;TCGA数据分析表明miR-20a与hnRNP K正相关,且在胃癌中高表达.结论:胃癌细胞中高表达hnRNP K蛋白上调miR-20a的表达.
作者：方海云；郭佳慧；高丰厚
来源：现代肿瘤医学 2020 年 28卷 5期
