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目的 探讨胃癌中DNA甲基化转移酶(DNMT1、DNMT3A、DNMT3B)表达的临床意义与预后的相关性.方法 运用TCGA和GEO数据库分析DNA甲基化转移酶在胃癌和正常组织中的表达差异;运用生存期分析软件Kaplan-Meier plotter分析DNA甲基化转移酶对胃癌患者预后的影响;下载TCGA和GEO数据库中的原始数据,分析DNA甲基化转移酶与临床病理参数之间的关系;采用基因富集分析(GSEA)结合蛋白互作网络进行DNMT3B的生物学功能研究.TCGA数据库分析DNMT3B升高促进胃癌进展的具体机制.结果 在胃癌组织中3种DNA甲基化转移酶的表达均高于癌旁正常组织;生存分析结果发现,DNMT3A、DNMT3B高表达的患者总生存期较短;DNMT3B表达与组织学分型相关,在肠型胃癌中表达较高;幽门螺旋杆菌感染可促进DNMT3B表达;DNMT3B可能通过影响BUB1、HDAC2的甲基化促进胃癌的进展.结论 DNA甲基化转移酶在胃癌组织中高表达,DNMT3B是胃癌患者的一个预后指标,可能成为临床诊治胃癌的生物标志物.

作者:褚晏;刘端瑞;朱文帅;樊荣;马晓丽;汪运山;郏雁飞

来源:山东大学学报(医学版) 2021 年 59卷 7期

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褚晏;刘端瑞;朱文帅;樊荣;马晓丽;汪运山;郏雁飞
来源:
山东大学学报(医学版) 2021 年 59卷 7期
标签:
DNA甲基化转移酶 胃癌 预后 TCGA数据库 GEO数据库
目的 探讨胃癌中DNA甲基化转移酶(DNMT1、DNMT3A、DNMT3B)表达的临床意义与预后的相关性.方法 运用TCGA和GEO数据库分析DNA甲基化转移酶在胃癌和正常组织中的表达差异;运用生存期分析软件Kaplan-Meier plotter分析DNA甲基化转移酶对胃癌患者预后的影响;下载TCGA和GEO数据库中的原始数据,分析DNA甲基化转移酶与临床病理参数之间的关系;采用基因富集分析(GSEA)结合蛋白互作网络进行DNMT3B的生物学功能研究.TCGA数据库分析DNMT3B升高促进胃癌进展的具体机制.结果 在胃癌组织中3种DNA甲基化转移酶的表达均高于癌旁正常组织;生存分析结果发现,DNMT3A、DNMT3B高表达的患者总生存期较短;DNMT3B表达与组织学分型相关,在肠型胃癌中表达较高;幽门螺旋杆菌感染可促进DNMT3B表达;DNMT3B可能通过影响BUB1、HDAC2的甲基化促进胃癌的进展.结论 DNA甲基化转移酶在胃癌组织中高表达,DNMT3B是胃癌患者的一个预后指标,可能成为临床诊治胃癌的生物标志物.