目的 通过TCGA和GEO数据库关于肝细胞癌病例的数据挖掘,扫描全基因组范围内的肝细胞癌预后相关的甲基化位点.方法 本研究采用TCGA、GSE54503、GSE57956和GSE37988肝细胞癌病例的数据集分析共同的甲基化位点,比较肝细胞癌和癌旁组织甲基化水平差异,得出共同的差异甲基化位点.采用Cox比例风险模型分析各差异位点甲基化水平对肝细胞癌总生存率影响,评估其与对应基因mRNA表达的相关性,进一步评估mRNA表达对肝细胞癌预后的影响.结果 肝细胞癌预后相关最显著的甲基化位点为位于基因TFCP2区域的cg20927059(P=0.003),对应的HR值及95
作者:张斯娜;郭小娟;陈钢
来源:肝胆胰外科杂志 2019 年 31卷 1期