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目的 探讨基于GEO和TCGA数据库中9个结直肠癌(CRC)预后相关基因所构建的预测模型对CRC预后的预测效能.方法 收集接受腹腔镜CRC根治术的患者350例,记录患者临床病理资料,实时荧光定量PCR法检测患者CRC组织中基于GEO和TCGA数据库筛选出的9个CRC预后相关基因(CLK1、SLC2A3、LIPG、EPHB2、ATOH1、PLCB4、GZMB、CKMT2和CXCL11)表达.术后随访12个月,根据是否出现肿瘤复发或癌因性死亡,将患者判定为有疾病进展或无进展.对比有进展及无进展患者各基因表达,使用多因素Cox回归方程分析影响CRC患者疾病进展的相关因素;使用R软件ggrisk包构建CRC患者多基因预后预测模型,采用受试者工作特征曲线(ROC)评估预后预测模型的预测效能.结果 术后随访12个月,350例CRC患者中260例未出现疾病进展,90例出现疾病进展,总进展率为25.71

作者:高艳红;李华

来源:山东医药 2023 年 63卷 17期

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作者:
高艳红;李华
来源:
山东医药 2023 年 63卷 17期
标签:
生物信息学 预后模型 GEO数据库 TCGA数据库 结直肠癌
目的 探讨基于GEO和TCGA数据库中9个结直肠癌(CRC)预后相关基因所构建的预测模型对CRC预后的预测效能.方法 收集接受腹腔镜CRC根治术的患者350例,记录患者临床病理资料,实时荧光定量PCR法检测患者CRC组织中基于GEO和TCGA数据库筛选出的9个CRC预后相关基因(CLK1、SLC2A3、LIPG、EPHB2、ATOH1、PLCB4、GZMB、CKMT2和CXCL11)表达.术后随访12个月,根据是否出现肿瘤复发或癌因性死亡,将患者判定为有疾病进展或无进展.对比有进展及无进展患者各基因表达,使用多因素Cox回归方程分析影响CRC患者疾病进展的相关因素;使用R软件ggrisk包构建CRC患者多基因预后预测模型,采用受试者工作特征曲线(ROC)评估预后预测模型的预测效能.结果 术后随访12个月,350例CRC患者中260例未出现疾病进展,90例出现疾病进展,总进展率为25.71