目的:基于TCGA数据库构建胃癌lncRNA预后风险评估模型.方法:从TCGA数据库中下载胃癌基因组表达数据及临床信息,通过R语言"DESeq2"包分析得到差异表达的lncRNA.采用单因素Cox回归和多因素Cox回归分析构建预后风险评估模型,采用ROC曲线进行效能评估.结果:首先以l ogFC>1或logFC<1,Adjusted-P-Value<0.05为筛选标准,发现58个lncRNA差异表达.单因素Cox回归分析结果显示3个lncRNA(AC097478.1、AC097478.3、AL354719.2)与预后显著相关,多因素Cox回归分析成功构建预后风险评估模型,风险评分=-0.05425×AC097478.1+0.08442×AC097478.3+0.12647×AL354719.2.风险评分高的患者预后较差.模型的5年ROC曲线下面积AUC=0.964(训练集).结论:通过生物信息学分析,成功构建了基于AC097478.1、AC097478.3、AL354719.2的预后风险评分模型,具有良好的预测效能.
作者:史爽;李娟;王雪;王允山;李培龙;杜鲁涛;王传新
来源:中国现代普通外科进展 2020 年 23卷 4期