您的账号已在其他设备登录,您当前账号已强迫下线,
如非您本人操作,建议您在会员中心进行密码修改

确定
收藏 | 浏览100 | 下载69

目的 构建肝细胞癌(HCC)患者铜死亡相关基因(CRGs)的预后模型.方法 基于TCGA数据库HCC患者的mRNA数据集,分析CRGs在HCC患者中的表达,对CRGs及相关基因进行GO和KEGG富集分析.Kaplan-Meier生存分析曲线评估CRGs的生存预后价值,分析其与免疫细胞浸润的相关性.单因素Cox回归分析筛选出与HCC患者生存预后显著相关的CRGs,Lasso回归和多因素Cox回归分析构建预后模型.根据风险值对患者进行分组并进行生存分析,ROC曲线评估预后模型,单因素和多因素Cox回归分析风险评分及临床因素与预后的关系.结果 分析得到HCC中差异表达CRGs共11个,CRGs及其相关基因主要富集的GO条目为氧化还原酶活性,作用于供体的醛基或氧基,主要富集的KEGG信号通路为碳代谢.CRGs的表达水平与浆细胞样滤泡树突细胞、T辅助细胞等免疫细胞的浸润显著相关(P<0.05).筛选并构建3个CRGs的预后模型,包括CDKN2A、DLAT和LIPT1.高风险组和低风险组的生存时间存在显著差异(P<0.001).风险评分是预后不良的独立危险因素(P<0.001).结论 基于TCGA数据库数据构建CRGs的HCC患者预后模型,可为评估HCC患者的预后提供思路.

作者:雷青松;李麟

来源:肿瘤防治研究 2023 年 50卷 3期

知识库介绍

临床诊疗知识库该平台旨在解决临床医护人员在学习、工作中对医学信息的需求,方便快速、便捷的获取实用的医学信息,辅助临床决策参考。该库包含疾病、药品、检查、指南规范、病例文献及循证文献等多种丰富权威的临床资源。

详细介绍
热门关注
免责声明:本知识库提供的有关内容等信息仅供学习参考,不代替医生的诊断和医嘱。

收藏
| 浏览:100 | 下载:69
作者:
雷青松;李麟
来源:
肿瘤防治研究 2023 年 50卷 3期
标签:
铜死亡 肝细胞癌 TCGA数据库 预后模型
目的 构建肝细胞癌(HCC)患者铜死亡相关基因(CRGs)的预后模型.方法 基于TCGA数据库HCC患者的mRNA数据集,分析CRGs在HCC患者中的表达,对CRGs及相关基因进行GO和KEGG富集分析.Kaplan-Meier生存分析曲线评估CRGs的生存预后价值,分析其与免疫细胞浸润的相关性.单因素Cox回归分析筛选出与HCC患者生存预后显著相关的CRGs,Lasso回归和多因素Cox回归分析构建预后模型.根据风险值对患者进行分组并进行生存分析,ROC曲线评估预后模型,单因素和多因素Cox回归分析风险评分及临床因素与预后的关系.结果 分析得到HCC中差异表达CRGs共11个,CRGs及其相关基因主要富集的GO条目为氧化还原酶活性,作用于供体的醛基或氧基,主要富集的KEGG信号通路为碳代谢.CRGs的表达水平与浆细胞样滤泡树突细胞、T辅助细胞等免疫细胞的浸润显著相关(P<0.05).筛选并构建3个CRGs的预后模型,包括CDKN2A、DLAT和LIPT1.高风险组和低风险组的生存时间存在显著差异(P<0.001).风险评分是预后不良的独立危险因素(P<0.001).结论 基于TCGA数据库数据构建CRGs的HCC患者预后模型,可为评估HCC患者的预后提供思路.