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目的:通过构建多囊卵巢综合征(polycystic ovary syndrome,PCOS)患者卵丘颗粒细胞的环状RNA(circular RNA,circRNA)-微小RNA(microRNA,miRNA)-信使RNA(messenger RNA,mRNA)调控网络,并进行临床标本验证,以探寻PCOS发病机制并提供诊疗靶点。方法:使用R软件分析来自基因表达图谱(gene expression omnibus,GEO)数据库的数据,得到差异表达的circRNA、miRNA、mRNA;使用CircInteractome、Starbase数据库,预测构建circRNA-miRNA-mRNA调控网络。回顾性研究收集2018年1月至2018年12月期间于郑州大学第二附属医院生殖医学部就诊的PCOS患者(记为PCOS组, n=40)和因男方或者输卵管因素治疗的患者(记为对照组, n=20)的卵丘颗粒细胞,提取RNA后进行实时荧光定量PCR(real time quantitative PCR,RT-qPCR)验证。 结果:筛选出278个差异表达mRNA、23个差异miRNA和2402个差异circRNA( P<0.05和 |log 2FC|>0.8);构建256条circRNA-miRNA-mRNA调控网络,包含13个mRNA、2个miRNA和40个circRNA;临床验证后提示,妊娠相关血浆蛋白A(pregnancy-associated plasma protein A,PAPPA)、hsa-miR-127-3p、hsa_circ_0086809/hsa_circ_0063556及其调控网络与PCOS相关(

作者:马丽影;张乐;许晓婷;窦倩;范晓明;项云改;李朋粉;谭丽

来源:中华生殖与避孕杂志 2022 年 42卷 5期

知识库介绍

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作者:
马丽影;张乐;许晓婷;窦倩;范晓明;项云改;李朋粉;谭丽
来源:
中华生殖与避孕杂志 2022 年 42卷 5期
标签:
多囊卵巢综合征 卵丘颗粒细胞 基因表达图谱 Polycystic ovary syndrome Cumulus cells Gene expression omnibus
目的:通过构建多囊卵巢综合征(polycystic ovary syndrome,PCOS)患者卵丘颗粒细胞的环状RNA(circular RNA,circRNA)-微小RNA(microRNA,miRNA)-信使RNA(messenger RNA,mRNA)调控网络,并进行临床标本验证,以探寻PCOS发病机制并提供诊疗靶点。方法:使用R软件分析来自基因表达图谱(gene expression omnibus,GEO)数据库的数据,得到差异表达的circRNA、miRNA、mRNA;使用CircInteractome、Starbase数据库,预测构建circRNA-miRNA-mRNA调控网络。回顾性研究收集2018年1月至2018年12月期间于郑州大学第二附属医院生殖医学部就诊的PCOS患者(记为PCOS组, n=40)和因男方或者输卵管因素治疗的患者(记为对照组, n=20)的卵丘颗粒细胞,提取RNA后进行实时荧光定量PCR(real time quantitative PCR,RT-qPCR)验证。 结果:筛选出278个差异表达mRNA、23个差异miRNA和2402个差异circRNA( P<0.05和 |log 2FC|>0.8);构建256条circRNA-miRNA-mRNA调控网络,包含13个mRNA、2个miRNA和40个circRNA;临床验证后提示,妊娠相关血浆蛋白A(pregnancy-associated plasma protein A,PAPPA)、hsa-miR-127-3p、hsa_circ_0086809/hsa_circ_0063556及其调控网络与PCOS相关(