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目的预测HumCyr61基因的变异剪接转录本,并通过分析其在不同组织中的表达谱进行验证,以便初步探讨HumCyr61基因的功能.方法应用计算机辅助的电子杂交步移策略,通过对比查询数据库返回的ESTs序列和先前克隆的HumCyr61 cDNA序列,预测了HumCyr61基因的变异剪接转录本.将HumCyr61基因片段制备探针后与含有人体8个组织mRNA的MTNI膜杂交,进行表达谱分析.结果计算机预测HumCyr61基因存在3个潜在的变异剪接位点,暗示该基因可能具有3种不同的转录本. Northern杂交结果显示,此基因在所检测的8种组织中除脑组织不表达外,其他7种组织中均存在一种大小基本一致的转录本,约2.4kb,该转录本在肾脏和骨骼肌中高度表达,在胎盘、心脏、肺脏中中度表达,在胰腺、肝脏中低度表达.杂交结果还显示,此基因在胰腺和胎盘组织中存在一种约3.5kb的条带,在骨骼肌中存在另一种约5.0kb的条带.结论电子杂交步移预测及Northern杂交结果证实了HumCyr61基因变异剪接位点的存在.

作者:陈政;傅风云;毕安定;蒋滢;张宏来;蒋菊香

来源:苏州医学院学报 2000 年 20卷 6期

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作者:
陈政;傅风云;毕安定;蒋滢;张宏来;蒋菊香
来源:
苏州医学院学报 2000 年 20卷 6期
标签:
HumCyr61基因 变异剪接 Northern杂交 组织表达谱
目的预测HumCyr61基因的变异剪接转录本,并通过分析其在不同组织中的表达谱进行验证,以便初步探讨HumCyr61基因的功能.方法应用计算机辅助的电子杂交步移策略,通过对比查询数据库返回的ESTs序列和先前克隆的HumCyr61 cDNA序列,预测了HumCyr61基因的变异剪接转录本.将HumCyr61基因片段制备探针后与含有人体8个组织mRNA的MTNI膜杂交,进行表达谱分析.结果计算机预测HumCyr61基因存在3个潜在的变异剪接位点,暗示该基因可能具有3种不同的转录本. Northern杂交结果显示,此基因在所检测的8种组织中除脑组织不表达外,其他7种组织中均存在一种大小基本一致的转录本,约2.4kb,该转录本在肾脏和骨骼肌中高度表达,在胎盘、心脏、肺脏中中度表达,在胰腺、肝脏中低度表达.杂交结果还显示,此基因在胰腺和胎盘组织中存在一种约3.5kb的条带,在骨骼肌中存在另一种约5.0kb的条带.结论电子杂交步移预测及Northern杂交结果证实了HumCyr61基因变异剪接位点的存在.