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目的 研究E2F家族在宫颈癌中的表达、预后价值以及与免疫浸润之间的关系.方法 采用Oncomine数据库分析E2F转录因子家族在不同类型癌症中的表达差异.采用GEPIA 2数据库分析E2F转录因子家族在宫颈癌组织与正常组织中的表达及不同临床分期间的差异.采用Kaplan-Meier plotter数据库分析E2F转录因子家族在宫颈癌中的预后价值.使用cBioPortal数据库进行E2F转录因子家族的共表达基因和遗传学突变分析.采用WebGestalt数据库对E2F家族相关基因进行功能及通路的富集分析.采用TIMER 2.0数据库分析E2F转录因子家族与宫颈癌中免疫细胞浸润的相关性.结果 宫颈癌中E2F1、E2F2、E2F3、E2F7、E2F8的表达均较正常宫颈组织高,但与临床分期无明显相关性.预后分析显示,E2F1高表达和E2F3低表达与患者更长的总生存期(overall survival,OS)和无复发生存期(recurrence free survival,RFS)明显相关.基因变异分析显示,E2F1基因变异率为5%,为E2F家族中最高.计算宫颈癌E2F家族成员之间的相关性结果表明,E2F2与E2F7、E2F8的表达,E2F3与E2F5的表达,E2F7与E2F8的表达均呈正相关;E2F2与E2F5的表达呈负相关.GO分析显示,E2F基因家族的相关功能主要指向生物调节和能量代谢;KEGG分析显示,E2F基因家族主要与细胞分裂、衰老及细胞周期密切相关.T

作者:陈玥;佘婧瑶;陈思;曹莹;梁春云;卢燕;王佩娟;公真

来源:山东第一医科大学(山东省医学科学院)学报 2023 年 44卷 3期

知识库介绍

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作者:
陈玥;佘婧瑶;陈思;曹莹;梁春云;卢燕;王佩娟;公真
来源:
山东第一医科大学(山东省医学科学院)学报 2023 年 44卷 3期
标签:
宫颈癌 E2F转录因子家族 预后 免疫细胞浸润 生物信息学
目的 研究E2F家族在宫颈癌中的表达、预后价值以及与免疫浸润之间的关系.方法 采用Oncomine数据库分析E2F转录因子家族在不同类型癌症中的表达差异.采用GEPIA 2数据库分析E2F转录因子家族在宫颈癌组织与正常组织中的表达及不同临床分期间的差异.采用Kaplan-Meier plotter数据库分析E2F转录因子家族在宫颈癌中的预后价值.使用cBioPortal数据库进行E2F转录因子家族的共表达基因和遗传学突变分析.采用WebGestalt数据库对E2F家族相关基因进行功能及通路的富集分析.采用TIMER 2.0数据库分析E2F转录因子家族与宫颈癌中免疫细胞浸润的相关性.结果 宫颈癌中E2F1、E2F2、E2F3、E2F7、E2F8的表达均较正常宫颈组织高,但与临床分期无明显相关性.预后分析显示,E2F1高表达和E2F3低表达与患者更长的总生存期(overall survival,OS)和无复发生存期(recurrence free survival,RFS)明显相关.基因变异分析显示,E2F1基因变异率为5%,为E2F家族中最高.计算宫颈癌E2F家族成员之间的相关性结果表明,E2F2与E2F7、E2F8的表达,E2F3与E2F5的表达,E2F7与E2F8的表达均呈正相关;E2F2与E2F5的表达呈负相关.GO分析显示,E2F基因家族的相关功能主要指向生物调节和能量代谢;KEGG分析显示,E2F基因家族主要与细胞分裂、衰老及细胞周期密切相关.T