目的 构建RNA结合蛋白(RBP)相关长链非编码RNA(IncRNA)预后模型,为临床预测结直肠癌(CRC)患者的生存提供指导.方法 分析TCGA数据库中的398例结直肠癌组织标本及39例正常对照样本的数据,从EBI-CA网站(https://ebiac.uk/GOA/)获取RBP相关基因列表.应用R软件分析RBP相关基因的差异表达基因,GO富集分析对RBP相关基因的差异表达基因进行功能注释,采用相关性分析筛选与RBP基因相关的IncRNA.采用R软件caret程序包将筛选后的355例CRC样本按50％ 与50％ 的比例随机分为训练集及验证集.单因素Cox回归分析筛选与预后相关的RBP相关IncRNA,LASSO Cox回归分析方法用于确定最佳预后RBP相关IncRNA并构建预后模型.使用多因素Cox回归系数计算风险评分,分析低风险组和高风险组风险评分与CRC患者临床特征及总体生存时间的关系,并使用验证集进行验证.结合独立预后因素构建诺模图预测结直肠癌患者1、2、3年生存率,建议标准曲线进行验证.结果 RBP相关基因差异表达基因中,327个基因表达上调,166个基因表达下调.994个IncRNA被鉴定为RBP相关IncRNA(R2>0.4,P<0.001),其中29个IncRNA具有预后价值.3个RBP相关IncRNA(LINC02474,NKILA,ZEN1-AS1)与CRC患者的总体生存率显著相关,用于构建预后模型.高风险组和低风险组结直肠癌患者总体生存
作者：刘娟；彭洪；吴洪；柏丹；舒子龙；屈艳；敬剑英；杨淑娟
来源：西部医学 2022 年 34卷 1期
