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以地黄为材料,通过分析地黄转录组数据,设计特异性引物,克隆了地黄牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合酶(geranylgeranyl pyrophosphate synthase,GGPPS)基因的cDNA序列,命名为RgGGPPS1,GenBank登录号为KU258808.同时在生物信息学分析的基础上,进行原核表达、纯化以及组织特异性表达分析.结果显示:(1)RgGGPPS1基因开放阅读框为987 bp,编码328个氨基酸.(2)生物信息学分析结果显示,RgGGPPS1蛋白含有2个富含天冬氨酸的基序(DDXXXXDD和DDXXD),与芝麻等双子叶植物中的GGPPS蛋白相似性较高.(3)利用构建的原核表达载体pET-32a-RgGGPPS1在大肠杆菌BL21(DE3)菌株中成功表达RgGGPPS1重组蛋白,采用Ni2+亲和层析得到了纯化的RgGGPPS1重组蛋白.(4)荧光定量PCR结果显示,RgGGPPS1基因在根中表达量最高,叶、茎中表达量较低.研究结果为进一步研究RgGGPPS1基因在地黄环烯醚萜苷生物合成途径中的功能奠定了基础.

作者:赵乐;史晶晶;马利刚;何庆祥;冯卫生;郑晓珂;朱昀昊

来源:西北植物学报 2016 年 36卷 5期

知识库介绍

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作者:
赵乐;史晶晶;马利刚;何庆祥;冯卫生;郑晓珂;朱昀昊
来源:
西北植物学报 2016 年 36卷 5期
标签:
地黄 RgGGPPS1基因 生物信息学分析 原核表达 表达分析 Rehmannia glutinosa RgGGPPS1 gene bioinformatic analysis prokaryotic expression expression analysis
以地黄为材料,通过分析地黄转录组数据,设计特异性引物,克隆了地黄牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合酶(geranylgeranyl pyrophosphate synthase,GGPPS)基因的cDNA序列,命名为RgGGPPS1,GenBank登录号为KU258808.同时在生物信息学分析的基础上,进行原核表达、纯化以及组织特异性表达分析.结果显示:(1)RgGGPPS1基因开放阅读框为987 bp,编码328个氨基酸.(2)生物信息学分析结果显示,RgGGPPS1蛋白含有2个富含天冬氨酸的基序(DDXXXXDD和DDXXD),与芝麻等双子叶植物中的GGPPS蛋白相似性较高.(3)利用构建的原核表达载体pET-32a-RgGGPPS1在大肠杆菌BL21(DE3)菌株中成功表达RgGGPPS1重组蛋白,采用Ni2+亲和层析得到了纯化的RgGGPPS1重组蛋白.(4)荧光定量PCR结果显示,RgGGPPS1基因在根中表达量最高,叶、茎中表达量较低.研究结果为进一步研究RgGGPPS1基因在地黄环烯醚萜苷生物合成途径中的功能奠定了基础.