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目的 通过分析宫颈腺癌(CAC)的mRNAs差异表达谱及模型mRNAs的基因集富集分析(GSEA),寻找其稳定可靠的靶向治疗、预后评估的新型分子标志物.方法 2019年8—10月在兰州大学第一医院实施研究.下载癌症基因组图谱数据库(TCGA)中CAC的mRNAs相关数据,使用R3.6.1软件进行差异分析、mRNAs筛选和预后模型构建.使用GSEA_4.0.1软件进行模型mRNAs的癌症和效应特征基因集富集分析.结果 经单因素Cox回归、Lasso回归分析、多因素Cox逐步回归分析获得CAC患者预后评估的列线图模型.该模型C-指数为0.95,3年生存率的AUC为0.9501,5年生存率的AUC为0.9497,风险评分为0.94474×CILP+3.86633×MYH13-3.7763×ANKRD53-1.91299×GLIPR2-0.64192×CPQ,生存分析提示低风险组患者生存预后显著优于高风险组(P<0.05).经基因集富集分析显示,VEGF_A_UP.V1_UP、MYC TARGETS V1和MTORC1 SIGNALING基因集分别与4个和3个模型mRNAs显著相关.结论 列线图模型可有效预测CAC患者生存状况,模型mRNAs可能通过VEGF_A_UP.V1_UP、MYC TARGETS V1和MTORC1 SIGNALING等途径影响患者预后,模型mRNAs及其核心基因集有望成为靶向治疗、预后评估的新靶标.

作者:张钗红;关德凤;杨永秀

来源:疑难病杂志 2020 年 19卷 3期

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作者:
张钗红;关德凤;杨永秀
来源:
疑难病杂志 2020 年 19卷 3期
标签:
宫颈腺癌 生存分析 mRNA 基因组富集分析 癌症基因组图谱数据库 列线图模型
目的 通过分析宫颈腺癌(CAC)的mRNAs差异表达谱及模型mRNAs的基因集富集分析(GSEA),寻找其稳定可靠的靶向治疗、预后评估的新型分子标志物.方法 2019年8—10月在兰州大学第一医院实施研究.下载癌症基因组图谱数据库(TCGA)中CAC的mRNAs相关数据,使用R3.6.1软件进行差异分析、mRNAs筛选和预后模型构建.使用GSEA_4.0.1软件进行模型mRNAs的癌症和效应特征基因集富集分析.结果 经单因素Cox回归、Lasso回归分析、多因素Cox逐步回归分析获得CAC患者预后评估的列线图模型.该模型C-指数为0.95,3年生存率的AUC为0.9501,5年生存率的AUC为0.9497,风险评分为0.94474×CILP+3.86633×MYH13-3.7763×ANKRD53-1.91299×GLIPR2-0.64192×CPQ,生存分析提示低风险组患者生存预后显著优于高风险组(P<0.05).经基因集富集分析显示,VEGF_A_UP.V1_UP、MYC TARGETS V1和MTORC1 SIGNALING基因集分别与4个和3个模型mRNAs显著相关.结论 列线图模型可有效预测CAC患者生存状况,模型mRNAs可能通过VEGF_A_UP.V1_UP、MYC TARGETS V1和MTORC1 SIGNALING等途径影响患者预后,模型mRNAs及其核心基因集有望成为靶向治疗、预后评估的新靶标.