目的 生物信息学方法 是预测miRNA二级结构及miRNA靶基因的有用工具.miRNA、转录因子和靶基因之间的调控网络参与多种生理、病理活动的分子机制.文中用生物信息学方法 预测mir-144/451基因簇的调控网络结构.方法 运用多个在线数据库,研究miR-144/451基因簇的上游转录因子及下游靶基因间的多个反馈和前反馈环路,对参与miR-144/451基因簇调控环路的基因进行功能聚类分析,绘制miR-144/451基因簇的核心调控网络图.结果 miR-144/451基因簇与其上游转录因子GATA1有17个共调控的靶基因,与生物体蛋白磷酸化、性腺发育、上皮细胞分化、葡萄糖代谢等生化学过程密切相关,并参与胰岛素信号通路、哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of rapamycin,mTOR)信号通路、血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)信号通路、自然杀伤细胞介导的细胞毒作用、Toll样受体信号通路、ErbB信号通路及黄体酮调节卵细胞成熟等体内重要生理过程.结论 对miR-144/451基因簇调控网络的生物信息学分析有助于理解其在细胞发育、细胞周期调控和肿瘤发生过程中的作用机制,为后续实验提供了理论依据.
作者：聂伟伟；唐林；韦凤；陈龙邦；张辰宇；朱琳；李冬海；管晓翔
来源：医学研究生学报 2012 年 25卷 3期
