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目的 基于中药系统药理学数据库和分析平台TCMSP,运用计算机虚拟筛选技术寻找新型冠状病毒(SARS-CoV-2)3CL水解酶的中药小分子抑制剂,推测潜在抗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)中药及中药复方.方法 以SARS-CoV-2 3CL水解酶蛋白为靶点,利用Autodock Vina软件和Python脚本实现高通量分子对接,结合“ADME-Lipinski”规则进行再次筛选,以优选活性成分,推测关键中药及复方.基于网络药理学角度,构建成分-靶点-通路网络,推测核心药对的作用机制.结果 以SARS-CoV-2原配体为阳性对照,筛选出66个药动学性质良好的天然小分子抑制剂,优选出12味中药单味药,2个中药药对甘草-桑白皮和金银花-连翘,以及桑菊饮、桑菊饮合银翘散加减等12个中药处方作为抗SARS-CoV-2的候选方案.结论 基于高通量分子对接技术虚拟筛选SARS-CoV-2 3CL水解酶的中药小分子抑制剂及中药,结合网络药理学分析潜在分子机制,为中药抗击SARS-CoV-2提供了科学指导与理论依据.

作者:马青云;刘辰;杜海涛;张贵晟;闫滨;孙启慧;刘孝云;齐冬梅;杨勇;容蓉

来源:中草药 2020 年 51卷 6期

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作者:
马青云;刘辰;杜海涛;张贵晟;闫滨;孙启慧;刘孝云;齐冬梅;杨勇;容蓉
来源:
中草药 2020 年 51卷 6期
标签:
分子对接 新型冠状病毒 新型冠状病毒肺炎 3CL水解酶 中药小分子抑制剂 网络药理学 甘草-桑白皮 金银花-连翘
目的 基于中药系统药理学数据库和分析平台TCMSP,运用计算机虚拟筛选技术寻找新型冠状病毒(SARS-CoV-2)3CL水解酶的中药小分子抑制剂,推测潜在抗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)中药及中药复方.方法 以SARS-CoV-2 3CL水解酶蛋白为靶点,利用Autodock Vina软件和Python脚本实现高通量分子对接,结合“ADME-Lipinski”规则进行再次筛选,以优选活性成分,推测关键中药及复方.基于网络药理学角度,构建成分-靶点-通路网络,推测核心药对的作用机制.结果 以SARS-CoV-2原配体为阳性对照,筛选出66个药动学性质良好的天然小分子抑制剂,优选出12味中药单味药,2个中药药对甘草-桑白皮和金银花-连翘,以及桑菊饮、桑菊饮合银翘散加减等12个中药处方作为抗SARS-CoV-2的候选方案.结论 基于高通量分子对接技术虚拟筛选SARS-CoV-2 3CL水解酶的中药小分子抑制剂及中药,结合网络药理学分析潜在分子机制,为中药抗击SARS-CoV-2提供了科学指导与理论依据.