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目的::明确新疆地区水痘-带状疱疹病毒( VZV)流行的主要基因型。方法:采集6例水痘和119例带状疱疹患者的水疱液,提取标本中的DNA,PCR扩增ORF22、38、54、62 DNA片段并测序,测序结果与GenBank中的VZV参考株基因序列进行比较,并用DNAMAN软件分析核酸序列和酶切位点。结果: PCR后电泳显示125份疱液标本中有120份VZV阳性。通过ORF22酶切位点分析,120份VZV临床分离株经序列对比J型79株,M1型40株,E型1株;通过ORF38、54酶切位点分析,119例VZV临床分离株为Pst I+Bgl I+型,1株VZV为Pst I+ Bgl I-型;通过ORF62酶切位点分析,120株毒株均为Sma I-,都是野生株。结论:新疆地区水痘-带状疱疹病毒临床分离株主要为J型野生株。

作者:屈园园;杨洪;普雄明

来源:中国麻风皮肤病杂志 2015 年 9期

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作者:
屈园园;杨洪;普雄明
来源:
中国麻风皮肤病杂志 2015 年 9期
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水痘带状疱疹病毒 基因型 单核苷酸多态性 varicella-zoster virus genotype single nucleotide polymorphism
目的::明确新疆地区水痘-带状疱疹病毒( VZV)流行的主要基因型。方法:采集6例水痘和119例带状疱疹患者的水疱液,提取标本中的DNA,PCR扩增ORF22、38、54、62 DNA片段并测序,测序结果与GenBank中的VZV参考株基因序列进行比较,并用DNAMAN软件分析核酸序列和酶切位点。结果: PCR后电泳显示125份疱液标本中有120份VZV阳性。通过ORF22酶切位点分析,120份VZV临床分离株经序列对比J型79株,M1型40株,E型1株;通过ORF38、54酶切位点分析,119例VZV临床分离株为Pst I+Bgl I+型,1株VZV为Pst I+ Bgl I-型;通过ORF62酶切位点分析,120株毒株均为Sma I-,都是野生株。结论:新疆地区水痘-带状疱疹病毒临床分离株主要为J型野生株。