目的:通过生物信息学方法筛选肺外源性急性呼吸窘迫综合征(ARDSexp)的关键基因,探讨ARDSexp疾病早期相关基因变化,有望成为早期诊断ARDSexp的生物学指标及实施个体化治疗的有用工具.方法:在美国国立生物技术信息中心(NCBI)的公共基因芯片表达谱数据库(GEO)中下载基因芯片数据集GSE66890,利用GEO2R分析平台筛选出脓毒症并发ARDSexp患者和脓毒症对照组患者全血标本中的差异表达基因.利用DAVID数据库对差异表达基因进行基因GO功能富集分析和KEGG信号通路富集分析.使用STRING和Cytoscape软件构建蛋白相互作用网络并筛选出关键基因.结果:按照基因差异表达倍数(FC)>1.5且P<0.05的筛选条件,筛选出差异表达基因288个,其中上调基因128个,下调基因160个.GO富集分析表明差异表达基因主要参与了炎症反应、细胞防御等生物学过程,KEGG信号通路富集分析主要包括吞噬体、cGMP-PKG等信号通路.通过筛选获得8个关键基因,分别为CCR2、CXCR2、TAS2R20、TAS2R39、TAS2R40、S1PR1、HCAR2和HCAR3.结论:利用生物信息学方法可获得ARDSexp的差异表达基因、信号通路及关键基因等信息,可为深入探讨ARDSexp的发病机制和临床诊治提供新的研究靶点.
作者：汤娜娜；谢登海；杨国辉
来源：中国免疫学杂志 2021 年 37卷 13期
