目的 对2009年中国云南省昆明地区柯萨奇病毒B5(Coxsackievirus group B5,CVB5)的部分VP1基因序列进行分析,以了解CVB5的遗传特性.方法 收集2009年中国云南省昆明地区临床诊断为无菌性脑炎患儿的200份粪便标本,设计针对CVB的通用引物,利用半巢式RT-PCR扩增部分VP1基因.PCR产物直接测序后,采用Omiga 和Mega 5.05等生物学软件进行核苷酸、氨基酸序列及系统进化分析.结果 共分离出7株CVB5,其部分VP1基因之间的核苷酸和氨基酸序列同源性均较高,分别为92.7％～98.5％和93.6％～100.0％;与中国其他不同地区参考株的核苷酸序列同源性为80.1％～ 99.1％,其中与中国山东株98388-SD-CHN-1998同源性较低；与中国其他不同地区参考株的氨基酸序列同源性为84.4％～100.0％,其中与中国河南株CoxB5-Henan-2010和中国山东株98388-SD-CHN-1998之间同源性最低；与其他不同国家参考株比较,其核苷酸和氨基酸序列同源性分别在77.5％～ 89.1％和92.1％ ～ 96.3％之间；与原型株Faulkner的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为79.6％ ～ 80.9％和92.1％～ 95.4％.基因系统进化分析显示,分离的7株CVB5属于相对独立的1个分枝,中国流行株除98388-SD-CHN-1998外,构成1个分枝.结论 2009年中国云南省昆明地区CVB5流行株属于相同基因型.

作者：邵聪文；潘玥；邓新强；叶君；马忠飞；孙强明；马绍辉

来源：中国生物制品学杂志 2013 年 26卷 6期