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目的 对云南省柯萨奇病毒B组2型(coxsackievirus B2,CV-B2)不同时间分离的15株病毒VP1区3'端编码序列基因特征进行分析.方法 对云南省2005—2006年从急性迟缓性麻痹(acute flaccid paralysis,AFP)病例、2013年从健康儿童和2014年从手足口病(hand,foot and mouth dis-ease,HFMD)病例中分离到的15株CV-B2的VP1区3'端进行基因扩增和测序;根据文献从GenBank下载CV-B2 VP1编码序列作为参考序列,用MEGA5.2软件计算不同毒株间的核苷酸(nucleotide,nt)和氨基酸(amino acid,aa)差异率,并构建系统进化树,进行VP1区3'端编码序列基因特征和分子流行病学分析.结果 2005年云南省从232例AFP病例中分离到1株CV-B2,2006年从240例AFP病例中分离到1株CV-B2,2013年从400名健康儿童中分离到12株CV-B2,2014年从500例HFMD病例中分离到1株CV-B2.对15株CV-B2基因特征分析表明,CV-B2可分为5个基因型.基因型1(gen-otype 1)由原型株(prototype)Ohio-1和1988年中国台湾分离株01-1组成;基因型2由2006、2007和2010年法国株组成;基因型3由云南株、山东株、河南株、福建株和中国台湾株组成;基因型4由俄罗斯分离株、云南2005及2006年AFP分离株和印度株组成;基因型5由中国台湾分离株、山东株和澳大利亚新南威尔士株组成.CV-B2的基因型分布具

作者:周永明;徐闻;付晓庆;向以斌;周晓芳;寸建萍;姜黎黎;田炳均

来源:中华微生物学和免疫学杂志 2019 年 39卷 7期

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作者:
周永明;徐闻;付晓庆;向以斌;周晓芳;寸建萍;姜黎黎;田炳均
来源:
中华微生物学和免疫学杂志 2019 年 39卷 7期
标签:
柯萨奇病毒B2型 VP1基因 基因特征分析 Coxsackievirus B2 VP1 gene Genetic analysis
目的 对云南省柯萨奇病毒B组2型(coxsackievirus B2,CV-B2)不同时间分离的15株病毒VP1区3'端编码序列基因特征进行分析.方法 对云南省2005—2006年从急性迟缓性麻痹(acute flaccid paralysis,AFP)病例、2013年从健康儿童和2014年从手足口病(hand,foot and mouth dis-ease,HFMD)病例中分离到的15株CV-B2的VP1区3'端进行基因扩增和测序;根据文献从GenBank下载CV-B2 VP1编码序列作为参考序列,用MEGA5.2软件计算不同毒株间的核苷酸(nucleotide,nt)和氨基酸(amino acid,aa)差异率,并构建系统进化树,进行VP1区3'端编码序列基因特征和分子流行病学分析.结果 2005年云南省从232例AFP病例中分离到1株CV-B2,2006年从240例AFP病例中分离到1株CV-B2,2013年从400名健康儿童中分离到12株CV-B2,2014年从500例HFMD病例中分离到1株CV-B2.对15株CV-B2基因特征分析表明,CV-B2可分为5个基因型.基因型1(gen-otype 1)由原型株(prototype)Ohio-1和1988年中国台湾分离株01-1组成;基因型2由2006、2007和2010年法国株组成;基因型3由云南株、山东株、河南株、福建株和中国台湾株组成;基因型4由俄罗斯分离株、云南2005及2006年AFP分离株和印度株组成;基因型5由中国台湾分离株、山东株和澳大利亚新南威尔士株组成.CV-B2的基因型分布具