目的 分析一株柯萨奇病毒(Coxsackievirus,CV)B2分离株(CVB2)全VP1基因序列特征.方法 用RD细胞对10份HFMD疑似患儿的粪便标本进行病毒分离,利用RT-PCR法从分离的病毒中扩增VP1基因,并测序,采用NCBI BLAST、Mega 6.1和Geneious等软件进行序列分析,并构建系统进化树.结果 从10份HFMD疑似患儿粪便中分离到一株CVB2,命名为509/YN/CHN/2010,其全长VP1基因的核苷酸长度与其他CVB2一致,均为846 bp.与中国其他分离株的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为81.0% ~ 95.3%和97.9%~98.9%,而与国外分离株的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为81.1% ~ 87.8%和97.9% ~ 98.6%.在进化树上与其他中国分离株分属不同的两个分支,而与M10MG17亲缘关系较近.结论 509/YN/CHN/2010分离株为肠道病毒CVB2,为两个中国分支中的一支.
作者:苏婷;朱艳菊;闫姗姗;陈俊英;杨舜乔;潘明;陈伟;邵聪文;马绍辉
来源:中国生物制品学杂志 2015 年 28卷 1期