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目的 分析2020-2021年冬季长春市水痘-带状疱疹病毒(varicella-zoster virus,VZV)流行株的基因特征.方法 选择48例2020-2021年长春市水痘或带状疱疹患者为研究对象,制备疱疹液样本.提取VZV的DNA,以其为模板PCR扩增VZV基因组ORF22、ORF38、ORF54及ORF62特异性片段,并测序.将测序结果与各基因型VZV代表株的ORF22单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点进行比对;应用SnapGene软件寻找测序结果中ORF38-Pst Ⅰ、ORF54-Bgl Ⅰ和ORF62-Sma Ⅰ酶切位点,并与Oka株(Pst Ⅰ-Bgl Ⅰ+Sma Ⅰ+)进行比对.结果 48份疱疹液样本VZV基因ORF22-SNP位点碱基均与pOka株一致,为Clade2基因型.其中47份为Pst Ⅰ-Bgl Ⅰ+Sma Ⅰ+,1份为Pst Ⅰ-Bgl Ⅰ+Sma Ⅰ+,均为野毒株.结论 2020-2021年冬季长春市流行的VZV均为Clade2基因型的野毒株,且具有高度保守性.

作者:付兴烨;李晴;吕品;姜雪鸥;孟迪;张夫坤

来源:中国生物制品学杂志 2022 年 35卷 4期

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作者:
付兴烨;李晴;吕品;姜雪鸥;孟迪;张夫坤
来源:
中国生物制品学杂志 2022 年 35卷 4期
标签:
水痘-带状疱疹病毒 基因型 开放阅读框 单核苷酸多态性
目的 分析2020-2021年冬季长春市水痘-带状疱疹病毒(varicella-zoster virus,VZV)流行株的基因特征.方法 选择48例2020-2021年长春市水痘或带状疱疹患者为研究对象,制备疱疹液样本.提取VZV的DNA,以其为模板PCR扩增VZV基因组ORF22、ORF38、ORF54及ORF62特异性片段,并测序.将测序结果与各基因型VZV代表株的ORF22单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点进行比对;应用SnapGene软件寻找测序结果中ORF38-Pst Ⅰ、ORF54-Bgl Ⅰ和ORF62-Sma Ⅰ酶切位点,并与Oka株(Pst Ⅰ-Bgl Ⅰ+Sma Ⅰ+)进行比对.结果 48份疱疹液样本VZV基因ORF22-SNP位点碱基均与pOka株一致,为Clade2基因型.其中47份为Pst Ⅰ-Bgl Ⅰ+Sma Ⅰ+,1份为Pst Ⅰ-Bgl Ⅰ+Sma Ⅰ+,均为野毒株.结论 2020-2021年冬季长春市流行的VZV均为Clade2基因型的野毒株,且具有高度保守性.