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目的 介绍Radviz可视化的基本原理和方法,并将Radviz可视化应用于基因表达数据的分类和特征选择.方法 以结肠癌基因表达数据为例,结合启发式搜索和Vizrank可视化评估,利用Radviz可视化实现基因表达数据的分类和差异基因排序.结果 由Vizrank算法得到排序前100的Radviz可视化结果,最优的Vizrank得分为0.9491,并得到了17个用于可视化分类的差异基因,其中部分基因获得了生物学解释.结论 Radviz能够形象的呈现隐含在数据中的模式特征,较好地用于基因表达数据的可视化分类和差异基因筛选.

作者:张涛;赵发林;武振宇;李康

来源:中国卫生统计 2011 年 28卷 1期

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张涛;赵发林;武振宇;李康
来源:
中国卫生统计 2011 年 28卷 1期
标签:
基因表达数据 Radviz 可视化 分类 特征选择
目的 介绍Radviz可视化的基本原理和方法,并将Radviz可视化应用于基因表达数据的分类和特征选择.方法 以结肠癌基因表达数据为例,结合启发式搜索和Vizrank可视化评估,利用Radviz可视化实现基因表达数据的分类和差异基因排序.结果 由Vizrank算法得到排序前100的Radviz可视化结果,最优的Vizrank得分为0.9491,并得到了17个用于可视化分类的差异基因,其中部分基因获得了生物学解释.结论 Radviz能够形象的呈现隐含在数据中的模式特征,较好地用于基因表达数据的可视化分类和差异基因筛选.