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目的 筛选血瘀质、非血瘀质非创伤性股骨头坏死(NONFH)患者与健康人外周血中差异表达的miRNA,建立miRNA表达谱,分析其生物学信息,为血瘀质NONFH的防治提供依据.方法 选取血瘀质、非血瘀质NONFH患者各10例(NONFH组)和健康志愿者8例(正常组),采用RT-PCR检测其血浆miRNA相对表达量,筛选差异表达的miRNA.应用实时荧光定量PCR对差异表达的hsa-miR-365a-3p、hsa-miR-483-3p进行验证.采用TargetScan、microRNAorg、PITA在线数据库对差异miRNA进行靶基因预测,并进行靶基因生物信息学分析.结果 与正常组比较,NONFH组有差异表达的miRNA 50个,其中上调21个,下调29个.与非血瘀质NONFH组比较,血瘀质NONFH组有差异表达的miRNA 33个,其中上调10个,下调23个.经筛选,最终确定血瘀质NONFH差异表达miRNA 5个.实时荧光定量PCR验证结果与miRNA芯片结果相符.3个在线数据库共筛选出交集靶基因1 1个,仅表达下调miRNA中hsa-miR-365a-3p检出交集靶基因11个,余未检测出交集靶基因.GO分析显示,差异表达miRNA主要与受体结合、蛋白及酶的活性有关.Pathway分析显示,血瘀质NONFH差异表达miRNA靶基因主要富集于轴突导向、Rap1、赖氨酸降解、Fc epsilonRI、甘油磷脂代谢、T细胞受体、血小板活化、成骨细胞分化等多个信号通路.结论 血瘀质NON

作者:周明旺;李盛华;邓昶;付志斌;吉星;陈彦同;胡星荣;刘一飞;王鹏志;赵秋玥

来源:中国中医药信息杂志 2020 年 27卷 8期

知识库介绍

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周明旺;李盛华;邓昶;付志斌;吉星;陈彦同;胡星荣;刘一飞;王鹏志;赵秋玥
来源:
中国中医药信息杂志 2020 年 27卷 8期
标签:
血瘀质 非创伤性股骨头坏死 miRNA 基因芯片 生物信息学
目的 筛选血瘀质、非血瘀质非创伤性股骨头坏死(NONFH)患者与健康人外周血中差异表达的miRNA,建立miRNA表达谱,分析其生物学信息,为血瘀质NONFH的防治提供依据.方法 选取血瘀质、非血瘀质NONFH患者各10例(NONFH组)和健康志愿者8例(正常组),采用RT-PCR检测其血浆miRNA相对表达量,筛选差异表达的miRNA.应用实时荧光定量PCR对差异表达的hsa-miR-365a-3p、hsa-miR-483-3p进行验证.采用TargetScan、microRNAorg、PITA在线数据库对差异miRNA进行靶基因预测,并进行靶基因生物信息学分析.结果 与正常组比较,NONFH组有差异表达的miRNA 50个,其中上调21个,下调29个.与非血瘀质NONFH组比较,血瘀质NONFH组有差异表达的miRNA 33个,其中上调10个,下调23个.经筛选,最终确定血瘀质NONFH差异表达miRNA 5个.实时荧光定量PCR验证结果与miRNA芯片结果相符.3个在线数据库共筛选出交集靶基因1 1个,仅表达下调miRNA中hsa-miR-365a-3p检出交集靶基因11个,余未检测出交集靶基因.GO分析显示,差异表达miRNA主要与受体结合、蛋白及酶的活性有关.Pathway分析显示,血瘀质NONFH差异表达miRNA靶基因主要富集于轴突导向、Rap1、赖氨酸降解、Fc epsilonRI、甘油磷脂代谢、T细胞受体、血小板活化、成骨细胞分化等多个信号通路.结论 血瘀质NON