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该研究通过网络药理学、分子对接技术和体外细胞实验,探究三七总皂苷(Panax notoginseng saponins,PNS)和骨碎补总黄酮(osteopractic total flavone,OTF)治疗骨质疏松症(osteoporosis,OP)的主要活性成分和潜在作用机制,为临床用药提供理论依据.首先通过文献检索和在线数据库获取OTF和PNS的入血成分,利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)与SwissTargetPrediction数据库获得药物的潜在靶点;借助OMIM、GeneCards数据库检索OP相关靶点,并利用韦恩在线分析工具将药物靶点和疾病靶点取交集;运用Cytoscape软件构建"药物-成分-靶点-疾病"网络,依据其节点度值筛选出核心成分;根据筛选出来的药物与疾病交集靶点,利用STRING平台和Cytoscape软件构建交集靶点的蛋白相互作用(PPI)网络,依据节点度值筛选出核心靶点;借助R语言对潜在治疗靶点进行GO功能富集和KEGG通路分析;并采用AutoDock Vina等软件对部分活性成分与潜在靶点进行分子对接验证;最后依据KEGG通路分析结果,选择HIF-1信号通路进行体外细胞实验验证.网络药理学结果得到里查酮A、苦参酮、20(R)-原人参三醇、20(S)-原人参三醇、山柰酚等45个活性成分,IL6、AKT1、TNF、VEGFA、MAPK3等103个治疗靶点,靶点蛋白富集的通路有PI3K-AKT信号通路、HIF-1信号通路、

作者:杨雯静;黄健;王维;彭立军;李晋玉;朱卫丰

来源:中国中药杂志 2023 年 48卷 4期

知识库介绍

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作者:
杨雯静;黄健;王维;彭立军;李晋玉;朱卫丰
来源:
中国中药杂志 2023 年 48卷 4期
标签:
网络药理学 骨质疏松症 三七总皂苷 骨碎补总黄酮 作用机制 分子对接 体外细胞实验
该研究通过网络药理学、分子对接技术和体外细胞实验,探究三七总皂苷(Panax notoginseng saponins,PNS)和骨碎补总黄酮(osteopractic total flavone,OTF)治疗骨质疏松症(osteoporosis,OP)的主要活性成分和潜在作用机制,为临床用药提供理论依据.首先通过文献检索和在线数据库获取OTF和PNS的入血成分,利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)与SwissTargetPrediction数据库获得药物的潜在靶点;借助OMIM、GeneCards数据库检索OP相关靶点,并利用韦恩在线分析工具将药物靶点和疾病靶点取交集;运用Cytoscape软件构建"药物-成分-靶点-疾病"网络,依据其节点度值筛选出核心成分;根据筛选出来的药物与疾病交集靶点,利用STRING平台和Cytoscape软件构建交集靶点的蛋白相互作用(PPI)网络,依据节点度值筛选出核心靶点;借助R语言对潜在治疗靶点进行GO功能富集和KEGG通路分析;并采用AutoDock Vina等软件对部分活性成分与潜在靶点进行分子对接验证;最后依据KEGG通路分析结果,选择HIF-1信号通路进行体外细胞实验验证.网络药理学结果得到里查酮A、苦参酮、20(R)-原人参三醇、20(S)-原人参三醇、山柰酚等45个活性成分,IL6、AKT1、TNF、VEGFA、MAPK3等103个治疗靶点,靶点蛋白富集的通路有PI3K-AKT信号通路、HIF-1信号通路、