目的:构建铜死亡相关基因标签(CRGS),基于CRGS预测肝细胞癌(HCC)患者的预后、免疫治疗反应及药物敏感性。方法:从国际癌症基因组联盟(ICGC)和癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载HCC患者的RNA测序和相应的临床数据,从人类蛋白质图谱图像分类(HPA)数据库获得肝癌组织和正常肝脏组织的蛋白表达信息,并从Migort210数据库下载HCC患者的基因表达信息和免疫治疗反应情况。基于TCGA队列,应用最小绝对值收敛和选择算法(LASSO)构建CRGS,计算每个样本的风险分数,根据风险分数的中位数对HCC患者进行分组:TCGA队列分为高风险组
TCGA和低风险组
TCGA,每组184例;ICGC队列分为高风险组
ICGC和低风险组
ICGC,每组116例。在Migort210队列中根据免疫治疗应答反应分为应答组(
n=68)和非应答组(
n=230)。评估CRGS预判TCGA队列中HCC患者预后的价值。在ICGC数据集中验证CRGS是否可用于预测HCC患者的预后。基于TCGA队列的数据,探讨CRGS预测HCC患者免疫治疗反应、药物敏感性的作用,同时应用Migort210免疫治疗队列验证CRGS预测恶性肿瘤免疫治疗中的临床价值。
结果:CRGS由4个铜死亡相关基因构成:GLS、CDKN2A、LIPT1和DLAT。高风险组
TCGA患者的总生存期(OS)、疾病特异
作者:丁瑞丽;赵传兵;景祎馨;陈榕;孟庆涛
来源:中华肝胆外科杂志 2023 年 29卷 6期