您的账号已在其他设备登录,您当前账号已强迫下线,
如非您本人操作,建议您在会员中心进行密码修改

确定
收藏 | 浏览29 | 下载1

目的:构建铜死亡相关基因标签(CRGS),基于CRGS预测肝细胞癌(HCC)患者的预后、免疫治疗反应及药物敏感性。方法:从国际癌症基因组联盟(ICGC)和癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载HCC患者的RNA测序和相应的临床数据,从人类蛋白质图谱图像分类(HPA)数据库获得肝癌组织和正常肝脏组织的蛋白表达信息,并从Migort210数据库下载HCC患者的基因表达信息和免疫治疗反应情况。基于TCGA队列,应用最小绝对值收敛和选择算法(LASSO)构建CRGS,计算每个样本的风险分数,根据风险分数的中位数对HCC患者进行分组:TCGA队列分为高风险组 TCGA和低风险组 TCGA,每组184例;ICGC队列分为高风险组 ICGC和低风险组 ICGC,每组116例。在Migort210队列中根据免疫治疗应答反应分为应答组( n=68)和非应答组( n=230)。评估CRGS预判TCGA队列中HCC患者预后的价值。在ICGC数据集中验证CRGS是否可用于预测HCC患者的预后。基于TCGA队列的数据,探讨CRGS预测HCC患者免疫治疗反应、药物敏感性的作用,同时应用Migort210免疫治疗队列验证CRGS预测恶性肿瘤免疫治疗中的临床价值。 结果:CRGS由4个铜死亡相关基因构成:GLS、CDKN2A、LIPT1和DLAT。高风险组 TCGA患者的总生存期(OS)、疾病特异

作者:丁瑞丽;赵传兵;景祎馨;陈榕;孟庆涛

来源:中华肝胆外科杂志 2023 年 29卷 6期

知识库介绍

临床诊疗知识库该平台旨在解决临床医护人员在学习、工作中对医学信息的需求,方便快速、便捷的获取实用的医学信息,辅助临床决策参考。该库包含疾病、药品、检查、指南规范、病例文献及循证文献等多种丰富权威的临床资源。

详细介绍
热门关注
免责声明:本知识库提供的有关内容等信息仅供学习参考,不代替医生的诊断和医嘱。

收藏
| 浏览:29 | 下载:1
作者:
丁瑞丽;赵传兵;景祎馨;陈榕;孟庆涛
来源:
中华肝胆外科杂志 2023 年 29卷 6期
标签:
癌,肝细胞 铜死亡 免疫治疗 预后 药物敏感性 Carcinoma, hepatocellular Cuproptosis Immunotherapy Prognosis Drug sensitivity
目的:构建铜死亡相关基因标签(CRGS),基于CRGS预测肝细胞癌(HCC)患者的预后、免疫治疗反应及药物敏感性。方法:从国际癌症基因组联盟(ICGC)和癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载HCC患者的RNA测序和相应的临床数据,从人类蛋白质图谱图像分类(HPA)数据库获得肝癌组织和正常肝脏组织的蛋白表达信息,并从Migort210数据库下载HCC患者的基因表达信息和免疫治疗反应情况。基于TCGA队列,应用最小绝对值收敛和选择算法(LASSO)构建CRGS,计算每个样本的风险分数,根据风险分数的中位数对HCC患者进行分组:TCGA队列分为高风险组 TCGA和低风险组 TCGA,每组184例;ICGC队列分为高风险组 ICGC和低风险组 ICGC,每组116例。在Migort210队列中根据免疫治疗应答反应分为应答组( n=68)和非应答组( n=230)。评估CRGS预判TCGA队列中HCC患者预后的价值。在ICGC数据集中验证CRGS是否可用于预测HCC患者的预后。基于TCGA队列的数据,探讨CRGS预测HCC患者免疫治疗反应、药物敏感性的作用,同时应用Migort210免疫治疗队列验证CRGS预测恶性肿瘤免疫治疗中的临床价值。 结果:CRGS由4个铜死亡相关基因构成:GLS、CDKN2A、LIPT1和DLAT。高风险组 TCGA患者的总生存期(OS)、疾病特异