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目的:基于mRNA高通量测序和生物信息学分析探讨胆囊癌发病机制。方法:本研究选取2017年1月至2018年10月在上海东方肝胆外科医院就诊的10例胆囊癌患者。对其胆囊癌组织及癌旁正常组织进行mRNA高通量测序,并进行生物信息学分析。结果:肿瘤组织与对应的癌旁正常组织相比,共鉴定出1 704个差异表达基因(DEGs),其中523个DEGs上调,1 181个DEGs下调。其中有674个DEGs显著富集到46个信号通路,包括PI3K-Akt、MAPK、Ras、Wnt等癌症相关信号通路,以及细胞运动相关通路,其中最显著的途径是神经活性配体- 受体相互作用信号途径,45个基因显著富集到钙信号通路。结论:基于高通量mRNA测序和生物信息学技术分析显示胆囊癌和癌旁正常组织存在DEGs, 神经活性的配体- 受体相互作用信号通路改变最为显著,钙信号传导途径异常揭示了慢性结石性胆囊炎向胆囊癌转变的重要信号通路。

作者:徐畅;王敬晗;程庆保;刘辰;胡明泰;罗祥基;姜小清

来源:中华肝脏外科手术学电子杂志 2021 年 10卷 2期

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作者:
徐畅;王敬晗;程庆保;刘辰;胡明泰;罗祥基;姜小清
来源:
中华肝脏外科手术学电子杂志 2021 年 10卷 2期
标签:
胆囊肿瘤 高通量核苷酸测序 RNA,信使
目的:基于mRNA高通量测序和生物信息学分析探讨胆囊癌发病机制。方法:本研究选取2017年1月至2018年10月在上海东方肝胆外科医院就诊的10例胆囊癌患者。对其胆囊癌组织及癌旁正常组织进行mRNA高通量测序,并进行生物信息学分析。结果:肿瘤组织与对应的癌旁正常组织相比,共鉴定出1 704个差异表达基因(DEGs),其中523个DEGs上调,1 181个DEGs下调。其中有674个DEGs显著富集到46个信号通路,包括PI3K-Akt、MAPK、Ras、Wnt等癌症相关信号通路,以及细胞运动相关通路,其中最显著的途径是神经活性配体- 受体相互作用信号途径,45个基因显著富集到钙信号通路。结论:基于高通量mRNA测序和生物信息学技术分析显示胆囊癌和癌旁正常组织存在DEGs, 神经活性的配体- 受体相互作用信号通路改变最为显著,钙信号传导途径异常揭示了慢性结石性胆囊炎向胆囊癌转变的重要信号通路。