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目的 采用高通量焦磷酸测序技术比较根管治疗后伴或不伴根尖周炎患牙根管内微生物群落的构成差异,寻找与持续性根尖周感染相关的根管内可疑微生物.方法 临床采集根管治疗后伴根尖周炎患牙(伴根尖周炎组,10颗)和无根尖周炎患牙(无根尖周炎组,10颗)根管内微生物群落样本.提取样本中细菌的总DNA,PCR扩增其对应于16S rRNA片段上的V1~ V3高变区基因片段以构建宏基因组文库.经焦磷酸测序后进行种系发育分析、多样性分析和主成分分析(PcoA分析).结果 共检出132种细菌,分属于21个菌门和96个菌属.在门水平,伴根尖周炎组群落的主要菌门为厚壁菌门[32%(18 534/58 688)]、变形菌门[27%(15 626/58 688)]、放线菌门[15%(8 685/58 688)]、拟杆菌门[11%(6 163/58 688)]、梭杆菌门[8%(4 761/58 688)]和螺旋体门[3%(1 785/58 688)].无根尖周炎组群落的主要菌门为厚壁菌门[31%(16 941/55 480)]、变形菌门[27%(14 748/55 480)]、拟杆菌门[18%(9 948/55 480)]、梭杆菌门[10%(5 307/55 480)]、放线菌门[9%(4 761/55 480)]和绿弯菌门[3%(1 785/55 480)].在丰度方面,伴根尖周炎组群落中的放线菌门显著高于无根尖周炎组(P<0.01).在检出率方面,放线菌在伴根尖周炎组和无根尖周炎组中分别是100%和50%.主成分分析结果

作者:王娟;唐志娟;李谨;张光东

来源:中华口腔医学杂志 2014 年 49卷 10期

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作者:
王娟;唐志娟;李谨;张光东
来源:
中华口腔医学杂志 2014 年 49卷 10期
标签:
根尖周炎 高通量核苷酸测序 生物膜 Periapical periodontitis High-throughput nucleotide sequencing Biofilms
目的 采用高通量焦磷酸测序技术比较根管治疗后伴或不伴根尖周炎患牙根管内微生物群落的构成差异,寻找与持续性根尖周感染相关的根管内可疑微生物.方法 临床采集根管治疗后伴根尖周炎患牙(伴根尖周炎组,10颗)和无根尖周炎患牙(无根尖周炎组,10颗)根管内微生物群落样本.提取样本中细菌的总DNA,PCR扩增其对应于16S rRNA片段上的V1~ V3高变区基因片段以构建宏基因组文库.经焦磷酸测序后进行种系发育分析、多样性分析和主成分分析(PcoA分析).结果 共检出132种细菌,分属于21个菌门和96个菌属.在门水平,伴根尖周炎组群落的主要菌门为厚壁菌门[32%(18 534/58 688)]、变形菌门[27%(15 626/58 688)]、放线菌门[15%(8 685/58 688)]、拟杆菌门[11%(6 163/58 688)]、梭杆菌门[8%(4 761/58 688)]和螺旋体门[3%(1 785/58 688)].无根尖周炎组群落的主要菌门为厚壁菌门[31%(16 941/55 480)]、变形菌门[27%(14 748/55 480)]、拟杆菌门[18%(9 948/55 480)]、梭杆菌门[10%(5 307/55 480)]、放线菌门[9%(4 761/55 480)]和绿弯菌门[3%(1 785/55 480)].在丰度方面,伴根尖周炎组群落中的放线菌门显著高于无根尖周炎组(P<0.01).在检出率方面,放线菌在伴根尖周炎组和无根尖周炎组中分别是100%和50%.主成分分析结果