目的:分析长链非编码RNA( long non-coding RNA,lncRNA)在肾透明细胞癌组织中的表达情况,并筛选出与肾透明细胞癌密切相关的lncRNA,探讨lncRNA在肾透明细胞癌诊断中的作用。方法2012年3月至2013年6月收集40例肾透明细胞癌患者的新鲜癌组织及癌旁组织,Trizol试剂提取总RNA,用Nanodrop 1000及变性琼脂糖凝胶电泳进行RNA检测。通过Arraystar Human LncRNA Microarray芯片筛选肾透明细胞癌组织与癌旁组织中的差异表达lncRNA,采用实时定量PCR方法验证所筛选的lncRNA在40对肾透明细胞癌组织与癌旁组织中的表达情况,采用受试者工作特征( receiver-operating characteristic,ROC)曲线验证所筛选lncRNA的诊断效率。结果与癌旁组织相比,在肾透明细胞癌组织中差异表达2倍以上的lncRNA有1787个,其中941个表达上调、846个表达下调。实时定量PCR测定NR_034095、NR_038974、ENST00000571724及ENST00000566575的表达水平与基因芯片分析结果一致。 NR_034095、NR_038974、ENST00000571724及ENST00000566575诊断肾透明细胞癌的ROC曲线下面积分别为0.928(95%CI 0.873~0.984)、0.759(95%CI 0.647~0.871)、0.833(95%CI 0.747~0.919)及0.887(95%CI 0.815~0.959)。结论 NR_03
作者:黄锦坤;戚德峰;李远奇;孙妍;孙红玲
来源:中华泌尿外科杂志 2015 年 6期