目的 分析2010年宁夏回族自治区流行的柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,CA16)VP1基因特征.方法 用特异引物通过逆转录聚合酶链反应(reverse transcriptase polymerase chain reaction,RT-PCR),对2010年分离自宁夏手足口病(hand,foot,and mouth disease,HFMD)病例的CA16毒株,进行VP1编码基因的扩增.扩增阳性产物进行序列测定,采用生物信息学软件进行分析.结果 本研究共获得62株CA16的VP1编码序列,其核苷酸和氨基酸序列同源性分别为90.1％ ～100％(平均94.5％)和98.7％ ～100％(平均99.6％).在亲缘性关系树上与B1基因亚型毒株位于相同分支,且各个地市流行株又同时存在B1a和B1b分支.结论 与全国流行情况相一致,宁夏2010年存在B1a和B1b分支CA16的共循环,毒株间具有较大的核苷酸序列差异,提示流行中存在多个传播链.
作者：檀晓娟；马江涛；陈慧；祝双利；詹军；许文波
来源：中华实验和临床病毒学杂志 2014 年 28卷 3期
